論文の概要: path_boost: A Python Package for Interpretable Graph-Level Prediction using Path-Based Gradient Boosting
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2607.07935v1
- Date: Wed, 08 Jul 2026 21:31:48 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-07-10 14:45:27.347545
- Title: path_boost: A Python Package for Interpretable Graph-Level Prediction using Path-Based Gradient Boosting
- Title(参考訳): path_boost:パスベースのグラディエントブースティングを用いた解釈可能なグラフレベル予測のためのPythonパッケージ
- Authors: Claudio Meggio, Johan Pensar, Riccardo De Bin,
- Abstract要約: Path_boostは、グラフ構造化された入力データに対する教師あり学習を解釈するためのPythonパッケージである。
PathBoostはパスベースの機能に対して付加的な予測モデルを生成する。
回帰分類と二分分類の両方をサポートする。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.6181093777643575
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: We present path_boost, a Python package for interpretable supervised learning on graph-structured input data. The package implements PathBoost, a gradient boosting algorithm that automatically discovers predictive labeled paths within graphs during the learning process. Unlike graph neural networks, which are generally difficult to interpret, PathBoost produces an additive prediction model over path-based features that explicitly reveals which substructures drive predictions. To avoid an exhaustive enumeration of all possible paths, the algorithm iteratively selects and extends paths during learning based on their predictive power, using boosting to combine weak learners into a strong ensemble. The package supports both regression and binary classification. Key features include compatibility with scikit-learn workflows, support for custom base learners and selectors, automatic starting node selection, parallel training across anchor nodes, and built-in variable importance computation. We demonstrate PathBoost on molecular property prediction of transition metal compounds, where atoms serve as nodes and bonds as edges, and further benchmark PathBoost against an established graph neural network and a graph kernel method across six molecular datasets. The package is available on PyPI and GitHub under an open-source license.
- Abstract(参考訳): path_boostは,グラフ構造化入力データに対する教師付き学習を解釈可能なPythonパッケージである。
このパッケージは、学習プロセス中にグラフ内の予測ラベル付きパスを自動的に検出する勾配向上アルゴリズムであるPathBoostを実装している。
一般的に解釈が難しいグラフニューラルネットワークとは異なり、PathBoostはパスベースの機能に対して付加的な予測モデルを生成し、どのサブ構造が予測を駆動するかを明確に示す。
全ての可能な経路の網羅的な列挙を避けるため、アルゴリズムは、弱い学習者を強いアンサンブルに組み合わせるために、予測力に基づいて学習中の経路を反復的に選択し、拡張する。
このパッケージは回帰分類とバイナリ分類の両方をサポートしている。
主な機能としては、Scikit-learnワークフローとの互換性、カスタムベースラーナーとセレクタのサポート、自動開始ノード選択、アンカーノード間の並列トレーニング、組込み変数重要計算などがある。
遷移金属化合物の分子特性予測において、原子がノードとして機能し、結合がエッジとして機能し、PathBoostが確立されたグラフニューラルネットワークと6つの分子データセットにまたがるグラフカーネル法に対してさらにベンチマークを行う。
パッケージはPyPIとGitHubでオープンソースライセンスで提供されている。
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