論文の概要: Bag-of-Visual-Words for Spatial Mapping of Lung Adenocarcinoma Growth Patterns
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2608.05074v1
- Date: Wed, 05 Aug 2026 17:17:36 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-08-06 14:48:44.041665
- Title: Bag-of-Visual-Words for Spatial Mapping of Lung Adenocarcinoma Growth Patterns
- Title(参考訳): 肺腺癌進展パターンの空間マッピングのためのbag-of-Visual-Words
- Authors: Darya Ardan, Valentin Oreiller, Henning Müller,
- Abstract要約: Bag-of-Visual-Words(BoVW)パイプラインは、注目領域(ROI)から抽出した凍結基礎モデル埋め込みから視覚語彙を学習する
パターンプロトタイプは同一ラベルROIのBoVWヒストグラムの平均として構築され,Jensen-Shannon分散下でのスライドウインドウ領域の最も近い原型分類に使用される。
CPTAC-LUAD患者87名を対象に,3つの基礎モデルエンコーダと2つの臨床的動機づけタスクにおける複数語彙サイズを用いた検討を行った。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 2.3230247783144873
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Spatial mapping of lung adenocarcinoma (LUAD) growth patterns across whole slide images (WSIs) requires resolving architectural context at the region level, yet existing methods operate at the individual tile level and produce generic morphological clusters rather than clinically defined pattern maps. We propose a weakly supervised Bag-of-Visual-Words (BoVW) pipeline that learns a visual vocabulary from frozen foundation model embeddings extracted from a small set of annotated regions of interest (ROIs). Pattern prototypes are constructed as mean BoVW histograms of same-label ROIs and used for nearest-prototype classification of sliding-window regions under Jensen--Shannon divergence. The resulting predictions are projected onto the WSI tile grid to produce interpretable spatial pattern maps. We evaluate the method on 87 CPTAC-LUAD patients using three foundation model encoders and multiple vocabulary sizes on two clinically motivated tasks. For tumour/healthy classification, the best configuration achieves a balanced accuracy of $0.974$ with H-Optimus-1, approaching the $0.987$ obtained by a supervised SVM trained on mean-pooled WSI embeddings. For binary histologic grade classification, the BoVW pipeline achieves higher balanced accuracy than the supervised baseline for all encoders, suggesting that ROI-level pattern decomposition preserves grade-relevant heterogeneity that is attenuated by global mean pooling.
- Abstract(参考訳): 肺腺癌 (LUAD) の成長パターンの局所的マッピングには, 地域レベルでのアーキテクチャ的コンテキストの解決が必要であるが, 既存の手法は個々のタイルレベルで動作し, 臨床で定義されたパターンマップではなく, 一般的な形態的クラスタを生成する。
本稿では,少量の注釈付き領域(ROI)から抽出した凍結基礎モデル埋め込みから視覚語彙を学習する,弱教師付きBag-of-Visual-Words(BoVW)パイプラインを提案する。
パターンプロトタイプは同一ラベルROIのBoVWヒストグラムの平均として構築され,Jensen-Shannon分散下でのスライドウインドウ領域の最も近い原型分類に使用される。
得られた予測はWSIタイルグリッドに投影され、解釈可能な空間パターンマップを生成する。
CPTAC-LUAD患者87名を対象に,3つの基礎モデルエンコーダと2つの臨床的動機づけタスクにおける複数語彙サイズを用いた検討を行った。
腫瘍/健康分類において、最良の構成は、平均プールされたWSI埋め込みで訓練された教師付きSVMが取得した0.974$とH-Optimus-1とのバランスの取れた精度を0.987$に近づける。
2値の組織学的グレード分類では、BoVWパイプラインは全エンコーダの教師付きベースラインよりも高い平衡精度を達成し、ROIレベルのパターン分解はグローバル平均プーリングによって減衰される等級関連不均一性を保っていることを示唆している。
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