論文の概要: ARISE: An adaptive residual-informed stability ensemble for feature selection in small-sample biomedical omics
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2608.14866v1
- Date: Fri, 14 Aug 2026 20:10:22 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-08-18 19:59:03.116279
- Title: ARISE: An adaptive residual-informed stability ensemble for feature selection in small-sample biomedical omics
- Title(参考訳): ARISE:小サンプルバイオメディカルオミクスにおける特徴選択のための適応的残留インフォームド安定性アンサンブル
- Abstract要約: 小サンプル分子分類では、予測的、安定的、および非冗長なサブセットを二項および多クラスの結果として識別するセレクタが必要である。
本稿では, 相補的関連信号, クラスバランス安定性評価, 残差インフォームド冗長性制御, マルチクラス対のカバレッジを統合したARISEを提案する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.7286424005725253
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Objective: Small-sample molecular classification requires feature selectors that identify predictive, stable, and nonredundant subsets for binary and multiclass outcomes. We propose ARISE (Adaptive Residual-Informed Stability Ensemble), which integrates complementary relevance signals, class-balanced stability assessment, residual-informed redundancy control, and multiclass pairwise coverage. Methods: ARISE combines seven percentile-normalized relevance components through 15 predefined profiles, adaptively weighted by nested inner cross-validation. It was evaluated on five molecular datasets, eight feature-set sizes, three fixed classifiers (k-nearest neighbours, support vector machine, and random forest), and six filter comparators. Generalization was estimated by five-fold outer cross-validation repeated 50 times using balanced accuracy, macro-F1, and Cohen's kappa. Results: Across 210,000 held-out assessments, ARISE ranked first in all 15 dataset-metric combinations. Equal-dataset means were 0.793 for balanced accuracy, 0.776 for macro-F1, and 0.725 for kappa, exceeding the strongest aggregate comparator by 0.022, 0.023, and 0.028, respectively. Performance remained strong across compact feature sets, although the optimal budget differed by dataset. Conclusion: ARISE provides a transparent, adaptive framework that jointly addresses relevance, stability, redundancy, and multiclass discrimination. Its consistent results across datasets, classifiers, metrics, and feature-set sizes support further evaluation for small-sample molecular classification.
- Abstract(参考訳): 目的: 小サンプル分子分類では、二項および多クラスの結果に対する予測的、安定的、および非冗長なサブセットを識別する特徴セレクタが必要である。
本稿では,ARISE(Adaptive Residual-Informed Stability Ensemble)を提案する。
方法: ARISEは15の事前定義されたプロファイルを通じて7%の正規化関連コンポーネントを結合し、ネストした内側のクロスバリデーションによって適応的に重み付けされる。
5つの分子データセット、8つの特徴セットサイズ、3つの固定分類器(k-アネレスト近傍、サポートベクターマシン、ランダムフォレスト)、6つのフィルターコンパレータで評価した。
一般化は, 平衡精度, マクロF1, コーエンカッパを50回繰り返して行った。
結果:ARISEは21万件のホールトアウトアセスメントを達成し、15のデータセットメトリックの組み合わせで第1位にランクインした。
平衡精度は0.793、マクロF1は0.776、カッパは0.725であり、それぞれ0.022、0.023、0.028を上回った。
最適な予算はデータセットによって異なるが、パフォーマンスはコンパクトな機能セット全体で強く保たれていた。
結論: ARISEは、関連性、安定性、冗長性、マルチクラス識別を共同で扱う、透過的で適応的なフレームワークを提供する。
データセット、分類器、メトリクス、特徴セットサイズにまたがる一貫性のある結果は、小さなサンプル分子分類のさらなる評価に役立つ。
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