論文の概要: Segmentation of the aorta in 4D flow MRI using 4D convolutional kernels and learning from sparse annotations
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2609.04439v1
- Date: Thu, 03 Sep 2026 19:59:08 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-09-07 18:15:23.80983
- Title: Segmentation of the aorta in 4D flow MRI using 4D convolutional kernels and learning from sparse annotations
- Title(参考訳): 4次元畳み込み核を用いた4次元血流MRIにおける大動脈の分別とスパースアノテーションからの学習
- Abstract要約: 再現性血行動態評価には,4次元血流MRIにおける大動脈分節の自動化が不可欠である。
上行大動脈,アーチ,下行大動脈を分節する完全自動4D(3D+time)U-Netを開発した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 26.56128921665582
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Automated aortic segmentation in 4D flow MRI is essential for reproducible hemodynamic assessment but is limited by scarce dense annotations and high computational demands. We developed a fully automated 4D (3D+time) U-Net for segmenting the ascending aorta, arch, and proximal descending aorta, using a parameter-efficient hybrid 4D kernel to capture temporal context and sparse 4D labels derived from existing 2D expert contours and centerlines, thereby avoiding the need for dense 4D annotations. Training comprised 268 scans from 8 centers and 2 vendors, with evaluation on an internal test set (32 scans) and an external post-contrast set (30 scans; different site, protocol, and annotator), compared against frame-wise 3D networks and two semi-automatic references. Against time-resolved annotations, the 4D U-Net achieved Dice scores of 0.927 (internal) and 0.911 (external), versus 0.919/0.847 for the 3D U-Net, 0.893 for static PC-MRA, and 0.808 for registration-based propagation; differences were small in systole but pronounced in diastole. Agreement with expert contours for peak velocity, net flow, axial and circumferential wall shear stress, and diameters was excellent (ICC >=0.954 internal, >=0.980 external), while semi-automatic references performed worse. The method thus provides reproducible, time-resolved aortic segmentation for automated hemodynamic analysis and generalizes across multicenter, multivendor, and independent post-contrast data. The model is publicly available.
- Abstract(参考訳): 再現性血行動態評価には4次元フローMRIにおける大動脈分節の自動抽出が不可欠であるが, 少ないアノテーションと高い計算要求により制限される。
パラメータ効率のよいハイブリッド4Dカーネルを用いて,上行大動脈,アーチ,近位下行大動脈をセグメント化するための完全自動化された4D (3D+time) U-Netを開発した。
トレーニングは、内部テストセット(32スキャン)と外部コントラストセット(30スキャン、サイト、プロトコル、アノテーション)の268のスキャンを、フレームワイドの3Dネットワークと2つの半自動参照と比較した。
時間分解アノテーションに対して、4D U-NetはDiceスコア0.927(内部)と0.911(外部)を、3D U-Netでは0.919/0.847、静的PC-MRAでは0.893、登録ベースの伝搬では0.808を達成した。
ピーク速度, ネットフロー, 軸方向および周方向壁せん断応力, 径に対する専門家の輪郭との一致は良好であった(ICC >=0.954 内部, >=0.980 外部)。
これにより、自動血行動態解析のための再現可能な時間分解大動脈セグメンテーションが提供され、マルチセンター、マルチベンダ、独立コントラストデータにまたがって一般化される。
モデルは公開されています。
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