論文の概要: Copula Adapted Directed Acyclic Graph for Cluster Representation of Biomedical Data
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2609.16240v1
- Date: Mon, 14 Sep 2026 19:07:53 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-09-16 14:56:08.195574
- Title: Copula Adapted Directed Acyclic Graph for Cluster Representation of Biomedical Data
- Title(参考訳): Copula Adapted Directed Acyclic Graph for Cluster Representation of Biomedical Data
- Abstract要約: 機能間の複雑な関係に基づく、ラベルなしのバイオメディカルデータのストラテファイリングは、データラベルの必要性を排除する。
従来のクラスタリング手法は制約のあるデータ分散を前提としており、複雑な依存関係をキャプチャするのに最適である。
本稿では,コプラモデルの非ガウス的および非線形的特徴依存を統合した,クラスタフレンドリーな新しいデータ提示フレームワークを提案する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Diagnostic errors and mislabeling are common in biomedicine, which compromise the reliability of predictive models and data-driven outcomes. Stratifying unlabeled biomedical data based on complex relationships between features eliminates the need for data labels and overcomes the limitations of supervised learning. Traditional clustering methods assume restrictive data distributions, making them suboptimal for capturing complex dependencies in high-dimensional biomedical data. This paper introduces a novel cluster-friendly data presentation framework that integrates the non-Gaussian and non-linear feature dependence of copula models with an ensemble of causal structure discovery (CSD) methods based on Directed Acyclic Graphs (DAGs). While copulas model flexible multivariate distributions by relaxing assumptions related to multivariate normality, linear dependence, and symmetric relationships, an ensemble of DAG-based CSD methods identifies stable causal relationships between features. When clustered using K-means, the new data representation obtained by the proposed copula-adapted DAG (CopDAG) ranks first among the 12 methods in normalized clustering accuracy and adjusted Rand index across 16 biomedical datasets. Our CopDAG method predicts ground-truth class labels directly from feature relationships without data annotations and supervised learning, while also providing cluster visualizations and explainable causal structures of the biomedical data features.
- Abstract(参考訳): 診断ミスと誤記は、予測モデルとデータ駆動結果の信頼性を損なう生医学において一般的である。
機能間の複雑な関係に基づく、ラベルなしのバイオメディカルデータのストラテファイリングは、データラベルの必要性を排除し、教師付き学習の限界を克服する。
従来のクラスタリング手法は制限的なデータ分布を前提としており、高次元のバイオメディカルデータの複雑な依存関係を捉えるのに最適である。
本稿では,コプラモデルの非ガウス的および非線形的特徴依存を,DAG(Directed Acyclic Graphs)に基づく因果構造探索(CSD)手法のアンサンブルと統合した,クラスタフレンドリーなデータ提示フレームワークを提案する。
コプラは多変量正規性、線形依存、対称関係に関する仮定を緩和することで柔軟な多変量分布をモデル化する一方で、DAGに基づくCSD法のアンサンブルは特徴間の安定した因果関係を同定する。
K-meansを用いてクラスタ化を行うと、提案したコプラ適応DAG(CopDAG)によって得られた新しいデータ表現は、正規化されたクラスタリング精度と16のバイオメディカルデータセットにわたる調整されたRandインデックスにおいて、12の手法の中で第一にランク付けされる。
筆者らのCopDAG法は,データアノテーションや教師あり学習を伴わない特徴関係から直接,地中構造クラスラベルを予測し,また,生医学データの特徴のクラスタ可視化や説明可能な因果構造も提供する。
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