論文の概要: WebMRIQC: A Web-Based Implementation of MRIQC for Accessible MRI Image Quality Assessment in Resource-Constrained Settings
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2609.24014v1
- Date: Mon, 21 Sep 2026 02:28:03 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-09-22 20:29:01.04248
- Title: WebMRIQC: A Web-Based Implementation of MRIQC for Accessible MRI Image Quality Assessment in Resource-Constrained Settings
- Title(参考訳): WebMRIQC:資源制約設定におけるアクセシブルMRI画像品質評価のためのMRIQCのWebベース実装
- Abstract要約: 我々は、検証済みのMRIQCエンジンをゼロインストールWebインターフェースでラップしたオープンソースのブラウザベースのプラットフォームであるWebMRIQCを紹介する。
WebMRIQCは、分離されたMRIスキャンのDICOM-to-BIDS変換を自動化し、公平なジョブキューによって管理される共有計算ノード上で変更されていないコンテナ化されたMRIQCパイプラインを実行し、インタラクティブなブラウザ内ダッシュボードを返す。
本稿では,BraTS-Africa および BraTS 2021 データセット上の13 IQM における WebMRIQC とネイティブ MRIQC の等価性を評価するためのシステムアーキテクチャと検証フレームワークについて述べる。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Reliable quality control (QC) of magnetic resonance imaging (MRI) is essential for reliable diagnostic neuroimaging, yet standard manual assessment is subjective and time-consuming. MRIQC has established standardized automated extraction of image-quality metrics (IQMs), but its reliance on local computational imaging skills and capacity including high-performance computing, limits its adoption in resource-constrained settings (RCS). We present WebMRIQC (webmriqc.mailab.io), an open-source browser-based platform that wraps the validated MRIQC engine behind a zero-installation web interface. WebMRIQC automates the DICOM-to-BIDS conversion of de-identified MRI scans, executes the unmodified containerized MRIQC pipeline on a shared compute node governed by a fair-share job queue, and returns an interactive in-browser dashboard. The dashboard grounds every IQM in published quality thresholds, benchmarks each scan against the normative distribution of high-resource open datasets, and supports cross-site multicentre implementation of optimized scan protocols in RCS.We describe the system architecture and a validation framework establishing measurement equivalence between WebMRIQC and native MRIQC across thirteen IQMs on the BraTS-Africa and BraTS 2021 datasets. Preliminary results indicate strong agreement for contrast-, signal and noise-based metrics, demonstrating that web-based implementation lowers the barrier to standardized MRI QC and provides a foundation for harmonized, regionally adapted quality benchmarks across RCS imaging sites. The code is publicly available here https://github.com/CAMERA-MRI/WebMRIqc.
- Abstract(参考訳): 磁気共鳴画像(MRI)の信頼性品質制御(QC)は、信頼性の高い診断神経画像撮影には不可欠であるが、標準的な手動評価は主観的で時間を要する。
MRIQCは、画像品質メトリクス(IQMs)の標準化された自動抽出を確立しているが、ローカルな計算画像技術と高性能コンピューティングを含む能力に依存するため、リソース制約設定(RCS)への採用を制限している。
我々は、ブラウザベースのオープンソースのプラットフォームであるWebMRIQC(webmriqc.mailab.io)を紹介し、検証済みのMRIQCエンジンをゼロインストールWebインターフェースでラップする。
WebMRIQCは、分離されたMRIスキャンのDICOM-to-BIDS変換を自動化し、公平なジョブキューによって管理される共有計算ノード上で変更されていないコンテナ化されたMRIQCパイプラインを実行し、インタラクティブなブラウザ内ダッシュボードを返す。
ダッシュボードは、すべてのIQMを公開品質のしきい値に設定し、各スキャンをハイリソースなオープンデータセットの規範的分布と比較し、RCSにおける最適化スキャンプロトコルのクロスサイトマルチセント実装をサポートする。システムアーキテクチャと、BraTS-AfricaおよびBraTS 2021データセット上の13のIQM間でWebMRIQCとネイティブMRIQCの等価性を測定する検証フレームワークについて説明する。
予備的な結果は、コントラスト、信号、ノイズベースのメトリクスに対する強い一致を示し、Webベースの実装が標準化されたMRI QCの障壁を低くし、RCSイメージングサイト全体で調和し、地域的に適応された品質ベンチマークの基盤を提供することを示す。
コードはhttps://github.com/CAMERA-MRI/WebMRIqc.comで公開されている。
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