論文の概要: Do Existing Preconditioners Improve Biomedical Tabular Foundation Learning? An Empirical Study on TabPFN Optimization
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2609.25013v1
- Date: Sat, 01 Aug 2026 16:50:19 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-09-28 05:09:55.83265
- Title: Do Existing Preconditioners Improve Biomedical Tabular Foundation Learning? An Empirical Study on TabPFN Optimization
- Title(参考訳): 既存のプレコンディショナーはバイオメディカルタブラリファウンデーション学習を改善するか? : TabPFN最適化に関する実証的研究
- Abstract要約: 我々は,AdamWをベースとしたTabPFN v2.5の精密調整のための5つのプレコンディショニング戦略を総合的に検討した。
この評価は、予測性能、計算効率、統計的意義分析を考察する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 9.610280855755999
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Tabular foundation models have recently shown strong potential for structured biomedical data analysis. Among them, TabPFN has emerged as an effective approach for low-data tabular classification tasks. However, the impact of optimization and preconditioning strategies on biomedical fine-tuning remains largely unexplored. In this work, we present a comprehensive empirical investigation of five AdamW-based preconditioning strategies for fine-tuning TabPFN v2.5 on 59 biomedical datasets spanning Alzheimer's disease, breast cancer, schizophrenia, significant memory concern (SMC), KEEL biomedical datasets, and UCI biomedical benchmarks. The evaluation considers predictive performance, computational efficiency, and statistical significance analysis. Experimental results demonstrate that the original AdamW optimizer consistently achieves the best overall performance and statistical ranking, while existing curvature-aware preconditioners fail to provide reliable improvements across diverse biomedical learning scenarios. The findings suggest that generic preconditioning approaches may not adequately capture the optimization characteristics of biomedical tabular learning, motivating the development of biomedical-aware preconditioners specifically tailored for healthcare-oriented tabular foundation models.
- Abstract(参考訳): タブラル基礎モデルは、最近、構造化バイオメディカルデータ分析の強力な可能性を示している。
その中でもTabPFNは、低データの表分類タスクに有効なアプローチとして登場した。
しかし, バイオメディカル微調整における最適化とプレコンディショニング戦略の影響は未解明のままである。
本研究では、アルツハイマー病、乳癌、統合失調症、重要な記憶障害(SMC)、KEELバイオメディカルデータセット、UCIバイオメディカルベンチマークにまたがる59のバイオメディカルデータセットについて、AdamWをベースとした5つのプレコンディショニング戦略を総合的に検討した。
この評価は、予測性能、計算効率、統計的意義分析を考察する。
実験結果から,AdamWオプティマイザは総合的な性能と統計的ランキングを一貫して達成し,既存の曲率対応プリコンディショナーは多様な生物医学的学習シナリオに対して信頼性の高い改善を提供していないことがわかった。
以上の結果から, 総合的なプレコンディショニングアプローチは, 医療指向の表インフォメーションモデルに適したバイオメディカル・アウェア・プレコンディショナーの開発を動機として, 生物医学的な表インフォメーション学習の最適化特性を適切に捉えていない可能性が示唆された。
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