論文の概要: RootQuantV2: Adapting a Vision Foundation Model for Root-Trait Regression from Minirhizotron Imagery
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2609.25567v1
- Date: Tue, 22 Sep 2026 01:59:04 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-09-23 18:04:04.17359
- Title: RootQuantV2: Adapting a Vision Foundation Model for Root-Trait Regression from Minirhizotron Imagery
- Title(参考訳): RootQuantV2:ミニリゾトロン画像からのルートトレーニング回帰に対するビジョン基礎モデルの適用
- Abstract要約: ミニリゾトロン(Minirhizotrons)は、フィールド環境における標準的な非破壊的なルートフェノタイピング法である。
RootQuantV2はRootQuantのCNNバックボーンを自己監督型のViTに置き換える。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: A lack of high-throughput phenotyping solutions for root traits in field-grown crops has severely constrained understanding and improvement of below-ground traits and processes. Minirhizotrons are the standard non-destructive root-phenotyping method in field environments. Computer vision solutions are needed to allow automated trait estimation at scale, but training data is scarce and human annotations are often inaccessible because they reside in proprietary software that only exports per-image scalar totals of root length and surface area. Nevertheless, large numeric archives of these root traits already exist. RootQuant showed that the traits can be predicted directly from the whole image by regression, thus removing manually traced masks from the pipeline; RootQuantV2 takes that idea further by replacing RootQuant's CNN backbone with a self-supervised ViT. We adapt a frozen DINOv3 ViT-L/16 with a hybrid parameter-efficient scheme. Training only 11.9M parameters (3.78% of the model), RootQuantV2 achieves length and area $R^2$ of 0.950 and 0.930, respectively, while lowering length/area RMSE by 24.3%/20.7% over RootQuant. RootQuantV2 thus repurposes legacy numeric archives for high-throughput, automated root trait estimation.
- Abstract(参考訳): 畑栽培作物の根形質に対する高スループット表現型解の欠如は、地下形質や過程の理解と改善を厳しく制限している。
ミニリゾトロン(Minirhizotrons)は、フィールド環境における標準的な非破壊的なルートフェノタイピング法である。
コンピュータビジョンソリューションは、大規模に自動的な特性推定を可能にするために必要とされているが、トレーニングデータが少なく、人間のアノテーションは、根長と表面積のスカラーの合計をエクスポートするだけのプロプライエタリなソフトウェアに常駐しているため、アクセスできないことが多い。
しかし、これらの根本特性の大規模な数値アーカイブは既に存在する。
RootQuantのCNNバックボーンを自己管理型のViTに置き換えることで、RootQuantV2はさらにそのアイデアを取り入れている。
凍結したDINOv3 ViT-L/16をパラメータ効率のハイブリッド方式で適用する。
モデルの1.9Mパラメータ(3.78%)のみをトレーニングし、RootQuantV2は長さと面積をそれぞれ$R^2$ 0.950と0.930とし、RootQuantより長さ/面積RMSEを24.3%/20.7%下げた。
これにより、RootQuantV2は、レガシな数値アーカイブを高スループットで自動化されたルート特性推定のために再利用する。
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