論文の概要: ArticleMiner: Ontology-Guided Knowledge Graph Construction from Scientific Publications
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2609.25607v1
- Date: Tue, 22 Sep 2026 03:01:47 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-09-23 18:04:04.18853
- Title: ArticleMiner: Ontology-Guided Knowledge Graph Construction from Scientific Publications
- Title(参考訳): ArticleMiner: 科学出版からのオントロジーガイドによる知識グラフ構築
- Abstract要約: ほとんどの科学論文は、その量的内容の多くを表や補足ファイルに保存しており、数字はヘッダー、キャプション、ユニット、分析方法、およびその分野の慣例を通してのみ意味する。
本研究は, 創薬化学, 材料科学, 機械学習, ミネラル地球化学の4つのモジュールを第1条の枠組みで構築し, 163の論文で評価する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 11.365651352111769
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Scientific papers keep much of their quantitative content in tables and supplementary files, where a number means something only through its header, caption, unit, analytical method, and the conventions of its field. Recovering the rows and columns of a table is therefore not the same as recovering the scientific fact it reports. Most semantic table-interpretation methods assume that a clean table is already available and subsequently map its cells or columns to ontology terms, whereas most publication-level extraction systems are designed for a single domain. We study a middle path: a shared process that reads a paper and its supplementary files, gathers evidence from several parsers and a language model, and reconciles that evidence, while a bounded human-authored task module for each task supplies the domain meaning. The module lists the canonical names the graph may use, the surface forms that map to them, a small set of derivation rules and validity constraints, an identity key, and the bindings used to write RDF. It defines what a task is allowed to emit; it does not try to list every convention of a field. We build four such modules (for drug-discovery chemistry, materials science, machine learning, and mineral geochemistry) in the ArticleMiner framework, and evaluate them on 163 papers, including a new geochemistry benchmark with expert-curated ground truth. In comparisons against a same-LLM few-shot baseline, the point estimates favor ArticleMiner on all four tasks, with uncertainty on the two smaller benchmarks. The geochemistry comparison also includes access to supplementary files, so its improvement cannot be attributed to domain guidance alone.
- Abstract(参考訳): 科学論文は、その量的内容の多くを表や補足ファイルに保存し、数字はそのヘッダー、キャプション、ユニット、分析方法、およびその分野の慣習を通じてのみ意味する。
したがって、テーブルの行と列を復元することは、それが報告する科学的事実を回復するのと同じではない。
ほとんどのセマンティックテーブル解釈法は、クリーンテーブルが既に利用可能であると仮定し、その後セルや列をオントロジーの用語にマッピングするが、ほとんどの出版レベルの抽出システムは単一のドメイン用に設計されている。
論文とその補足ファイルを読み、複数のパーサーと言語モデルから証拠を収集し、その証拠を精査する共有プロセスと、各タスクに対する有界な人間によるタスクモジュールがドメインの意味を提供する。
モジュールは、グラフが使用するであろう標準名、それらにマップする曲面形式、導出規則と妥当性制約の小さなセット、IDキー、RDFを書くのに使用されるバインディングを列挙する。
タスクが出力することを許すものを定義し、フィールドのすべての規約をリストアップしようとしない。
本研究は, 創薬化学, 材料科学, 機械学習, ミネラル地球化学の4つのモジュールを第1条の枠組みで構築し, 163の論文で評価する。
同じLLM数ショットのベースラインと比較すると、ポイント推定は4つのタスクすべてで、より小さなベンチマークでは不確実性がある。
ジオケミカル比較は補足ファイルへのアクセスも含むため、改善はドメインガイダンスのみによるものではない。
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