論文の概要: Mind the Gap: Mesh-Guided Repair of Broken Vessels
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2609.29779v1
- Date: Thu, 24 Sep 2026 13:22:19 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-09-25 21:10:09.951914
- Title: Mind the Gap: Mesh-Guided Repair of Broken Vessels
- Title(参考訳): マインド・ザ・ギャップ(Mind the Gap) : メッシュガイドによる壊れた船の修理
- Abstract要約: 本稿では nnU-Net が生成する壊れた船体セグメントを修復するためのメッシュ誘導後処理フレームワークを提案する。
予測された各バイナリマスクに対して、変形可能なテンプレートメッシュが物理空間のマスク表面に取り付けられ、ケース固有の幾何学的足場として使用される。
AortaSeg24とSEGAを大動脈,TopCoWをWillis,PARSEを肺動脈の3つの血管解剖学的検討を行った。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.22067925276806286
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Vessel segmentation is commonly optimized as voxel-wise classification, but small local errors can strongly disrupt vascular connectivity while having little effect on overlap scores. This is particularly problematic for downstream analyses that rely on centerlines, branches, connected components, or graph structure. We propose a mesh-guided post-processing framework for repairing broken vessel segmentations produced by nnU-Net. For each predicted binary mask, a deformable template mesh is fitted to the mask surface in physical space and used as a case-specific geometric scaffold. The fitted mesh is not voxelized as the final segmentation; instead, it guides conservative reconnection of disconnected components by proposing or validating thin bridge candidates under foreground-growth constraints. We evaluated this approach in three vascular anatomies using AortaSeg24 and SEGA for the aorta, TopCoW for the Circle of Willis, and PARSE for the pulmonary arteries. Performance is measured using Dice, connected-component Dice (ccDice), and the Betti-0 number. Across these datasets, repair substantially improved connectivity while preserving overlap: Dice remained nearly unchanged, whereas ccDice increased from 0.596 to 0.992 for aorta, from 0.722 to 0.835 for TopCoW, and from 0.028 to 0.862 for PARSE. The FOMAML meta-initialization further accelerated the fitting per-case, supporting practical mesh-based repair of the vascular topology. These results suggest that explicit mesh representations can provide a useful geometric prior for correcting topological failures in otherwise accurate voxel segmentations.
- Abstract(参考訳): 血管のセグメンテーションは一般にボクセル単位での分類として最適化されているが、小さな局所的な誤差は、オーバーラップスコアにほとんど影響を与えず、血管の接続性を著しく阻害する可能性がある。
これは特に、中心線、分岐、接続されたコンポーネント、あるいはグラフ構造に依存する下流分析において問題となる。
本稿では nnU-Net が生成する壊れた船体セグメントを修復するためのメッシュ誘導後処理フレームワークを提案する。
予測された各バイナリマスクに対して、変形可能なテンプレートメッシュが物理空間のマスク表面に取り付けられ、ケース固有の幾何学的足場として使用される。
適合メッシュは最終セグメンテーションとして酸化されるのではなく、フォアグラウンド・グロース制約の下で薄いブリッジ候補を提案または検証することにより、切断されたコンポーネントの保守的な再接続を誘導する。
AortaSeg24とSEGAを大動脈,TopCoWをWillis,PARSEを肺動脈の3つの血管解剖学的検討を行った。
Dice, connected-component Dice (ccDice), and the Betti-0 number。
Diceは0.596から0.992に、ccDiceは0.596から0.992に、TopCoWは0.722から0.835に、PARSEは0.028から0.862に増加した。
FOMAMLのメタ初期化により、ケースごとの嵌合が促進され、実用的なメッシュベースの血管トポロジーの修復が支援された。
これらの結果は、明示的なメッシュ表現が、それ以外は正確なボクセルセグメンテーションにおける位相的失敗の補正に有用な幾何学的事前を与えることを示唆している。
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