論文の概要: Bayesian Uncertainty Quantification for fMRI Functional Connectivity via Simulation-Based Inference
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2609.30445v1
- Date: Thu, 24 Sep 2026 18:37:12 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-09-28 18:27:51.103531
- Title: Bayesian Uncertainty Quantification for fMRI Functional Connectivity via Simulation-Based Inference
- Title(参考訳): シミュレーションベース推論によるfMRI機能接続性のベイズ不確かさの定量化
- Abstract要約: 我々は, スキャナノイズ, 被写体変動性, 取得時間などの不確実性を定量化する。
単目的レベルでは、7Tは3Tでは約7分、スキャン時間は40%削減される。
人口レベルでは、3Tはプールされた曲線が収束するためには、オブジェクトごとのスキャン時間が7Tの約37倍の時間を要する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.02333246928962178
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Optimizing fMRI scan duration and spatial resolution is critical for experimental design, yet traditional correlation-based approaches cannot quantify uncertainty or disentangle scanner measurement noise from true neural variability across subjects. Without principled uncertainty bounds, researchers cannot know whether a protocol is long enough to reliably estimate connectivity, or whether between-subject differences reflect biological variation or noise. We present a Bayesian framework modeling BOLD dynamics as coupled Ornstein-Uhlenbeck processes, using Sequential Neural Posterior Estimation to obtain connectivity posteriors while accounting for frequency-independent measurement noise across the BOLD spectrum. Applied to N = 28 healthy controls (55 scans) at 7T using a functional network atlas (65 DMN regions), the framework quantifies uncertainty across its sources: scanner noise, subject variability, and acquisition length. Spatial analysis identifies a mean of 46 voxels per ROI, roughly half of typical region sizes, as sufficient to achieve 90% of asymptotic precision. At the single-subject level, 7T reaches its within-session precision plateau in approximately 7 minutes versus 10 minutes for 3T, a 40% reduction in required scan time, providing the first direct, model-based quantification of the scan-time advantage conferred by higher field strength. At the population level, 3T requires roughly 37 times more per-subject scan time than 7T for the pooled curves to converge, confirming a consistent advantage of higher field strength at every timescale. Together these findings provide concrete, scanner-specific guidance for protocol optimization, with direct implications for reducing acquisition costs and improving the reliability of connectivity-based clinical biomarkers. We provide code enabling researchers to derive these bounds from their own data.
- Abstract(参考訳): fMRIスキャンの時間と空間分解能の最適化は、実験的な設計において重要であるが、従来の相関に基づくアプローチでは、被験者間の真のニューラルバリアビリティから不確実性やアンタングルスキャナ計測ノイズを定量化できない。
原則的な不確実性境界がなければ、研究者は、プロトコルが接続性を確実に見積もるに十分な長さなのか、オブジェクト間の差異が生物学的な変動やノイズを反映しているのかを判断できない。
本稿では,BOLDスペクトルの周波数非依存性測定ノイズを考慮に入れながら,逐次ニューラル後続推定を用いてBOLDダイナミックスを結合されたOrnstein-Uhlenbeckプロセスとしてモデル化したベイズフレームワークを提案する。
機能的ネットワークアトラス(65 DMN領域)を用いて、7TのN = 28健全な制御(55スキャン)に適用すると、このフレームワークは、スキャナノイズ、被検体可変性、取得長といったソース間の不確実性を定量化する。
空間分析では、ROIあたり平均46ボクセル(典型的な領域の約半分)を、漸近的精度の90%を達成するのに十分であるとしている。
単目的レベルでは、7Tは3Tでは約7分でセッション内精度台地に達し、3Tでは10分でスキャン時間が40%削減される。
人口レベルでは、3Tはプールされた曲線が収束するためには、オブジェクトごとのスキャン時間が7Tの約37倍の時間を要する。
これらの知見は, プロトコル最適化のための具体的, スキャナ固有のガイダンスを提供し, 取得コストの低減と, 接続性に基づく臨床バイオマーカーの信頼性の向上に寄与する。
私たちは、研究者が自身のデータからこれらの境界を導出できるコードを提供します。
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