論文の概要: Bridging the EHR Divide: Asymmetric Contrastive Learning for Cross-National Medical Representation Transfer
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2610.04946v1
- Date: Sun, 04 Oct 2026 04:39:58 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-10-08 02:58:29.34479
- Title: Bridging the EHR Divide: Asymmetric Contrastive Learning for Cross-National Medical Representation Transfer
- Title(参考訳): EHRディバイドのブリッジ:クロスナショナル医療表現伝達のための非対称コントラスト学習
- Abstract要約: 縦断的電子健康記録表現のシステム間転送は困難である。
本稿では,タスク固有の事前学習対象である非対称教師付きコントラスト学習(Asymmetric Supervised Contrastive Learning, Asymmetric SupCon)を紹介する。
台湾国民健康保険研究データベースに登録された398万例の経時的トランスフォーマ表現を事前訓練した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 10.009731457436141
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Cross-system transfer of longitudinal Electronic Health Record (EHR) representations is challenging because clinical coding, patient populations, and healthcare workflows differ substantially across institutions and countries. We introduce Asymmetric Supervised Contrastive Learning (Asymmetric SupCon), a task-specific pre-training objective motivated by the heterogeneity of negative clinical outcomes. The objective clusters patients sharing a target positive outcome without explicitly attracting negative trajectories toward one another. We pre-train temporal Transformer encoders on longitudinal records from 3.98 million patients in the Taiwanese National Health Insurance Research Database (NHIRD) and transfer them to two U.S. EHR datasets, MIMIC-IV and EHRSHOT. A hybrid semantic mapping pipeline combining direct mappings with embedding-based retrieval enables transfer across heterogeneous clinical vocabularies. On MIMIC-IV, NHIRD pre-training consistently improves over random initialization while substantially narrowing the performance gap to task-specific in-domain pre-training. On EHRSHOT, the transferred models show particularly strong few-shot performance for incident disease prediction. A controlled objective ablation shows that Asymmetric SupCon achieves the best AUPRC on three of four evaluated tasks and is 0.003 AUPRC below Standard SupCon on the fourth. These results support asymmetric contrastive pre-training as an effective approach for task-specific cross-national EHR representation transfer. Code is available at https://github.com/qingYzhang/Asymmetric_SupCon.
- Abstract(参考訳): エレクトロニック・ヘルス・レコード(EHR)の縦断的表現のシステム間転送は、臨床コーディング、患者数、医療ワークフローが制度や国によって大きく異なるため、困難である。
本研究は,非対称指導型コントラスト学習(Asymmetric Supervised Contrastive Learning, Asymmetric SupCon)を紹介する。
対象のクラスター患者は, 負の軌道を互いに明示的に引き付けることなく, 対象の正の結果を共有できた。
台湾国民健康保険研究データベース(NHIRD)の経時的トランスフォーマーエンコーダをトレーニングし,MIMIC-IV と EHRSHOT の2つの米国 EHR データセットに転送した。
直接マッピングと埋め込みに基づく検索を組み合わせたハイブリッドセマンティックマッピングパイプラインは、異種の臨床語彙間の移動を可能にする。
MIMIC-IVでは、NHIRD事前トレーニングは、タスク固有のドメイン内トレーニングにパフォーマンスギャップを大幅に狭めながら、ランダム初期化よりも一貫して改善する。
EHRSHOTでは、トランスファーモデルでは、特にインシデント疾患の予測において、いくつかのショットのパフォーマンスが強い。
制御対象アブレーションにより、Asymmetric SupConは4つの評価されたタスクのうち3つで最高のAUPRCを達成し、第4のStandard SupConより0.003 AUPRCであることが示された。
これらの結果は,非対称なコントラスト事前学習を,タスク固有の国家間EHR表現伝達の効果的なアプローチとして支持する。
コードはhttps://github.com/qingYzhang/Asymmetric_SupConで公開されている。
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