論文の概要: Latent Flow Matching for Molecular Graph Generation
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2610.06468v1
- Date: Mon, 05 Oct 2026 15:00:15 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-10-09 08:09:59.069483
- Title: Latent Flow Matching for Molecular Graph Generation
- Title(参考訳): 分子グラフ生成のための潜流整合
- Abstract要約: 事前訓練された変分オートエンコーダから得られるグラフ全体の潜在表現を明示的に生成する。
提案手法は, 最先端なグラフ生成モデルと比較して, 良好な品質効率のトレードオフを提供しながら, 高い妥当性とFCDを実現する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 16.80052703012206
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Modern graph generative models typically operate directly in the discrete graph space, explicitly generating node and edge variables, which can become costly as graphs grow. In this paper, we perform generation explicitly on latent representations of entire graphs obtained from a pretrained Variational Autoencoder with high reconstruction fidelity. The generated representations, obtained through flow matching, are then decoded only at the final step. Across molecular benchmarks of increasing size, our approach achieves strong validity and FCD while offering a favorable quality-efficiency trade-off compared with state-of-the-art explicit graph generative models. One of the main advantages of this formulation is that the graph representation only needs to be learned once, after which the same one can be reused across multiple generative objectives without retraining. We demonstrate generation guided by molecular properties and further introduce validity-aware generation though a classifier learned directly in latent space. All code will be made available upon acceptance.
- Abstract(参考訳): 現代のグラフ生成モデルは一般に離散グラフ空間で直接動作し、グラフが成長するにつれてコストがかかるノードとエッジ変数を明示的に生成する。
本稿では,事前訓練された変分オートエンコーダから得られたグラフ全体の潜在表現を,高い再構成精度で明示的に生成する。
生成された表現はフローマッチングによって得られ、最終ステップでのみデコードされる。
大規模化の分子ベンチマークにおいて,本手法は高い妥当性とFCDを実現するとともに,最先端の明示的なグラフ生成モデルと比較して,良好な品質・効率のトレードオフを提供する。
この定式化の主な利点の1つは、グラフ表現が一度だけ学習される必要があることである。
分子特性によって導かれる生成を実証し、さらに潜在空間で直接学習した分類器の妥当性を考慮した生成を導入する。
すべてのコードは受理時に利用可能になる。
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