論文の概要: SimCortex v2: Joint Cortical Surface Reconstruction with Near-Zero Collisions and Self-Intersections
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2610.07378v1
- Date: Mon, 05 Oct 2026 20:49:00 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-10-08 02:58:29.658539
- Title: SimCortex v2: Joint Cortical Surface Reconstruction with Near-Zero Collisions and Self-Intersections
- Title(参考訳): SimCortex v2: 近ゼロ衝突と自己切断を併用した関節皮質表面再構成
- Abstract要約: 我々は,T1強調MRIによる左右のWMおよびピアル面の同時再構成のためのディープラーニングフレームワークであるSimCortex v2を提案する。
SimCortex v2は、体積分割から位相的に正しい初期曲面を推定し、リボン条件のU-Net様ネットワークによって予測される複数スケールの定常速度場を用いて4つ全てを共同で洗練する。
560例のSimCortex v2,14例のコホート,13例のトレーニング中に見えなかったもの,6~89歳,健常者,臨床者,および3ベンダのスキャナーについて検討した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.34376560669160394
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Reconstructing cortical WM and pial surfaces from structural magnetic resonance imaging (MRI) is a prerequisite for surface-based neuroanatomical analysis, yet remains challenging because the cortex is thin and tightly folded. Reconstruction methods can produce geometric artifacts such as mesh self-intersections and collisions between cortical surfaces, and although recent deep learning methods have reduced reconstruction time from hours to minutes, these artifacts persist. We propose SimCortex v2, a deep learning framework for simultaneous reconstruction of the left and right WM and pial surfaces from T1-weighted MRI. SimCortex v2 estimates topologically correct initial surfaces from a volumetric segmentation and refines all four jointly using multi-scale stationary velocity fields predicted by a ribbon-conditioned, U-Net-like network. We evaluated SimCortex v2 on 560 cases from 14 cohorts, thirteen of them unseen during training, spanning ages 6-89, healthy and clinical populations, and scanners from three vendors. SimCortex v2 matched the surface-distance accuracy of the strongest baseline (average symmetric surface distance 0.253 mm) while showing no detected inter-surface collision in 92.14% of cases and the lowest self-intersection fraction (0.044%) among learning-based methods, whereas every baseline produced at least one collision in every case. Source code, configuration files, pretrained weights, preprocessed data, and the exact evaluation splits are publicly released.
- Abstract(参考訳): 構造的磁気共鳴画像(MRI)による大脳皮質のWMとピアル面の再構成は、表面神経解剖学的解析の必須条件であるが、大脳皮質は薄く、強く折り畳まれているため、いまだに困難である。
レコンストラクション法は、メッシュの自己断面積や皮質表面の衝突などの幾何学的アーティファクトを生成できるが、最近のディープラーニング法は、再構成時間を数時間から数分に短縮しているが、これらのアーティファクトは持続している。
我々は,T1強調MRIによる左右のWMおよびピアル面の同時再構成のためのディープラーニングフレームワークであるSimCortex v2を提案する。
SimCortex v2は、体積分割から位相的に正しい初期曲面を推定し、リボン条件のU-Netのようなネットワークによって予測される複数スケールの定常速度場を用いて4つ全てを共同で洗練する。
560例のSimCortex v2,14例のコホート,13例のトレーニング中に見えなかったもの,6~89歳,健常者,臨床者,および3ベンダのスキャナーについて検討した。
SimCortex v2は、最強のベースライン(平均対称表面距離0.253 mm)の表面距離の精度と一致し、92.14%のケースでは表面衝突が検出されず、学習ベースの手法では最も低い自己断面積(0.044%)を示した。
ソースコード、設定ファイル、事前訓練された重み付け、事前処理されたデータ、正確な評価分割が公開されている。
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