論文の概要: Hidden Data Challenges in Clinical Machine Learning
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2610.13350v1
- Date: Fri, 09 Oct 2026 10:28:03 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-10-13 04:06:29.524237
- Title: Hidden Data Challenges in Clinical Machine Learning
- Title(参考訳): 臨床機械学習における隠れデータ課題
- Abstract要約: セマンティクス,エピソード定義,エンドポイントの構成,モダリティの選択,不足処理といった曖昧さが,モデルで利用可能な情報をどのように変えるかを示す。
我々は、MIMIC-IVおよび関連する電子健康記録データセットの時間的、臨床的に整合性があり、再現可能な前処理のための実用的な勧告を導出する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 43.89454680711102
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
- Abstract: Widely reused preprocessing pipelines for electronic health records can encode assumptions about when information became available, what clinical episode a label represents, and what missingness means. These assumptions are rarely audited systematically and may propagate across subsequent studies when preprocessing pipelines are reused or adapted. Using MIMIC-IV as a case study, we identify and quantify violations of three complementary forms of preprocessing alignment, i.e., temporal, semantic, and population alignment, which manifest as temporal leakage, feature-task misalignment, and biased imputation. We show how ambiguities in timestamp semantics, episode definitions, endpoint construction, modality selection, and missingness handling can alter the information available to a model and affect the interpretation of its predictions. Through analyses of MIMIC-IV data and empirical case studies, we demonstrate that such choices may remain largely invisible in aggregate predictive performance while changing the signals on which models rely. We derive practical recommendations for temporally valid, clinically aligned, and reproducible preprocessing of MIMIC-IV and related electronic health record datasets. The code for our experiments, including our proposed preprocessing, is available at: https://github.com/m2l-lab/mimic-iv-preprocess.
- Abstract(参考訳): 電子健康記録のための広く再利用された前処理パイプラインは、情報がいつ利用可能になったか、ラベルがどの臨床エピソードを表すか、不足の意味について仮定を符号化することができる。
これらの仮定は体系的に監査されることはめったになく、前処理パイプラインを再利用したり、適応させたりする際には、その後の研究に影響を及ぼす可能性がある。
ケーススタディとしてMIMIC-IVを用いて,時間的漏洩,特徴視誤認,偏りを呈する3種類の前処理アライメント(時間的,意味的,集団的アライメント)の違反を同定し,定量化する。
タイムスタンプのセマンティクス,エピソード定義,エンドポイントの構成,モダリティの選択,不足処理の曖昧さが,モデルで利用可能な情報を変化させ,その予測の解釈にどのように影響するかを示す。
MIMIC-IVデータの解析と実験ケーススタディにより、これらの選択は、モデルが依存する信号を変化させながら、総合的な予測性能において、ほとんど見えないままであることを示した。
我々は、MIMIC-IVおよび関連する電子健康記録データセットの時間的、臨床的に整合性があり、再現可能な前処理のための実用的な勧告を導出する。
提案した前処理を含む我々の実験用コードは、https://github.com/m2l-lab/mimic-iv-preprocessで利用可能です。
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