論文の概要: Design Choices for Multimodal Transformer Learning with Missing and Longitudinal Healthcare Data
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2610.14436v1
- Date: Sat, 10 Oct 2026 01:05:53 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-10-20 21:32:58.617615
- Title: Design Choices for Multimodal Transformer Learning with Missing and Longitudinal Healthcare Data
- Title(参考訳): 欠席・縦断医療データを用いたマルチモーダルトランスフォーマー学習のための設計選択
- Abstract要約: マルチモーダル学習は、異種データソースからの相補的な情報を統合することにより、予測を改善する可能性を提供する。
不完全なマルチモーダルデータは、モダリティの欠如やモダリティの欠如といった課題をもたらす。
本研究では,3つの異なる癌データセットを用いて,これらの設計選択について検討する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 9.050510996987436
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Multimodal learning offers the potential to improve predictions by integrating complementary information from heterogeneous data sources. However, multimodal datasets are frequently incomplete, raising important questions about how models should handle missing information. Although recent approaches increasingly rely on Transformer-based architectures for multimodal fusion, incomplete multimodal data introduces challenges such as missing modalities and intra-modal missingness, which motivate key architectural design choices, such as tokenization granularity. In addition, many datasets are longitudinal, with observations collected across multiple time points. The sequential nature of the Transformer architectures provides a natural framework for modeling such data, but introduces additional considerations, such as how temporal information should be represented. In this study, we systematically investigate these design choices using three different cancer datasets. We compare modality-level and feature-level tokenization and evaluate attention masking and imputation as strategies for handling missing information, both naturally occurring in the datasets and synthetically induced. We further investigate approaches for incorporating temporal information in our training process and how to model it. Experiments are conducted with unimodal and multimodal configurations, as well as different levels of missingness for binary survival classification and multiple time encoding strategies for discrete-time survival prediction. Our results show that while multimodal outperforms unimodal results, missing data heavily impacts predictions and thus effective design choices such as tokenization granularity, and intra-missing handling is essential for reliable prediction.
- Abstract(参考訳): マルチモーダル学習は、異種データソースからの相補的な情報を統合することにより、予測を改善する可能性を提供する。
しかし、マルチモーダルデータセットはしばしば不完全であり、モデルがどのように行方不明の情報を扱うべきかという重要な疑問を提起する。
近年のアプローチではトランスフォーマーをベースとしたマルチモーダル融合のアーキテクチャにますます依存しているが、不完全なマルチモーダルデータにはモダリティの欠如や、トークン化の粒度などの重要な設計上の選択を動機付けるモダリティの欠如といった課題が伴っている。
さらに、多くのデータセットは縦長であり、観測は複数の時点にわたって収集される。
Transformerアーキテクチャのシーケンシャルな性質は、このようなデータをモデリングするための自然なフレームワークを提供するが、時間的情報をどのように表現すべきかといった追加の考慮を導入する。
本研究では,3つの異なる癌データセットを用いて,これらの設計選択を体系的に検討する。
本研究は,モダリティレベルのトークン化と特徴レベルのトークン化を比較し,アテンションマスキングとインプットを,データセット内で自然に発生し合成的に誘導される欠落情報を扱うための戦略として評価する。
さらに、時間的情報をトレーニングプロセスに組み込むためのアプローチと、それをモデル化する方法についても検討する。
一様および多モード構成で実験を行い、二項生存の分類と離散時間生存予測のための多重時間符号化戦略の相違点について実験を行った。
その結果、マルチモーダルは単調な結果よりも優れるが、欠落したデータは予測に大きく影響し、トークン化の粒度やミッション内ハンドリングといった効果的な設計選択は信頼性の高い予測に不可欠であることが示唆された。
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