論文の概要: Graph-Enhanced Disease Trajectory Discovery and Temporal Endpoint Forecasting from Longitudinal Electronic Health Records
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2610.20502v1
- Date: Wed, 14 Oct 2026 17:08:50 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-10-15 21:06:16.262829
- Title: Graph-Enhanced Disease Trajectory Discovery and Temporal Endpoint Forecasting from Longitudinal Electronic Health Records
- Title(参考訳): 縦断的電子健康記録からのグラフ化疾患の軌跡発見と時間的エンドポイント予測
- Abstract要約: 我々は,グラフ構築前に患者を分割し,列車のみの順応遷移を学習し,エンドポイント固有の分岐モチーフポリシーを凍結するグラフ拡張フレームワークを開発した。
最終カタログには99,527のモチーフと、エンドポイント毎に24の患者互換モチーフを検索するタイムアウェアトランスフォーマーが含まれていた。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 6.600299648478795
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Longitudinal electronic health records (EHRs) can reveal disease-progression structure, while useful forecasting requires leakage-controlled discovery, censor-aware outcomes, and inspectable trajectory evidence. We developed a graph-enhanced framework in MIMIC-IV v3.1 that splits patients before graph construction, learns train-only consecutive-admission transitions, and freezes endpoint-specific branching-motif policies selected on validation data. The final catalog contained 99,527 motifs, and a time-aware Transformer retrieved at most 24 patient-compatible motifs per endpoint through endpoint-specific cross-attention. Across five training seeds, micro-AUPRC increased from 0.9330 to 0.9357, while event-time MAE decreased from 676.9 to 657.7 days (reduction 19.2 days; 95% paired patient-cluster bootstrap CI, 13.8-24.8). Timing effects were heterogeneous: MAE worsened for events within 730 days but improved by 58.9 days for events occurring after 730 days. In an exploratory internal temporal split, branch conditioning reduced conditional event-time MAE by 26.9 days (95% CI, 23.0-30.8) without evidence of better micro-AUPRC. Corrected survival evaluation over the supported 0-2,555-day interval did not establish macro C-index or integrated Brier score superiority over a matched history-only discrete-hazard model. A directed, degree-matched GNN repair substantially improved unseen-edge discovery, yet replacing GNN-derived scores within fixed motif identities did not improve downstream forecasting. These results position branching motifs as structured trajectory context whose main value is long-range timing support rather than uniformly stronger endpoint discrimination, survival prediction, or causal explanation.
- Abstract(参考訳): 経時的電子健康記録(EHR)は、疾患の進行構造を明らかにすることができるが、有用な予測には、漏洩制御された発見、検閲された結果、検査可能な軌道証拠が必要である。
我々はMIMIC-IV v3.1でグラフ拡張フレームワークを開発し、グラフ構築前に患者を分割し、列車のみの連続順応遷移を学習し、検証データ上で選択されたエンドポイント固有の分岐-モチーフポリシーを凍結する。
最終カタログには99,527のモチーフと、エンドポイント固有のクロスアテンションを通じてエンドポイント毎の24の患者互換モチーフを検索するタイムアウェアトランスフォーマーが含まれていた。
5つの訓練種のうち、micro-AUPRCは0.9330から0.9357に増加し、イベントタイムMAEは676.9から657.7日(減算19.2日、95%対の患者クラスターブートストラップCI, 13.8-24.8)に減少した。
MAEは730日以内では悪化したが、730日以降では58.9日改善した。
探索的な内部時間分割では、分岐条件付けにより、より優れたマイクロAUPRCの証拠のない条件付きイベントタイムMAEが26.9日(95% CI、23.0-30.8)短縮された。
0-2,555日間隔での補正生存評価では,一致した履歴のみの離散ハザードモデルよりもマクロC指数やブリアスコアの優位性を確立できなかった。
指向性、等級整合性GNN修復は未確認の発見を大幅に改善したが、固定モチーフ内のGNN由来のスコアを置き換えることは下流予測の改善には至らなかった。
これらの結果は、分岐モチーフを、一様に強いエンドポイント識別、生存予測、因果的説明よりも、長距離タイミングサポートを主目的とする構造化軌道文脈として位置づける。
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