論文の概要: A Two-Level Clinical Novelty Prioritization Framework for Disease Trajectories Discovered from Longitudinal Electronic Health Records
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2610.20512v1
- Date: Wed, 14 Oct 2026 17:14:29 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-10-15 21:06:16.264466
- Title: A Two-Level Clinical Novelty Prioritization Framework for Disease Trajectories Discovered from Longitudinal Electronic Health Records
- Title(参考訳): 経時的電子カルテから発見された疾患軌跡の2段階的新規優先順位付けフレームワーク
- Abstract要約: 上流の患者分離型MIMIC-IV v3.1パイプラインで発見された99,527個の分岐モチーフを優先する。
このフレームワークは、パスレベルとノード間セマンティックスを信頼性調整された臨床上の優先度から分離する。
これらの知見は, 検出された軌跡の表現的, 不確実性を考慮した文献的相対的優先順位付けを支援する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 6.600299648478795
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Graph-based analysis of electronic health records (EHRs) yields disease-trajectory catalogs, but structural support does not establish semantic novelty. We present a two-level framework to prioritize 99,527 branching motifs previously discovered by an upstream patient-disjoint, train-only MIMIC-IV v3.1 pipeline and frozen after validation-based catalog selection. The framework separates path-level and node-to-endpoint semantic sparsity from reliability-adjusted clinical priority. Three deterministic textualizations per motif or node-target pair were embedded with BAAI/bge-small-en-v1.5 and calibrated against 166,972 pre-2023 PubMed references using mean top-20 cosine distance. Positive recombination occurred in 8.63% of motifs and had negligible effect on global ranking, whereas specificity and support/GNN reliability terms changed clinical-priority ordering. Robustness analyses across neighbor counts, templates, encoders, generic-label taxonomies, score settings, PrimeKG, and corrected density-based RND showed that broad ordering was more stable than hard top-k membership. A semantic-dose analysis did not support a monotonic relation between score and forecasting benefit after endpoint and token-count adjustment (1.96 days per SD; 95% CI, -0.75 to 4.68). In the frozen catalog-q90 high-semantic subgroup, branch-enhanced forecasting reduced conditional event-time MAE by 20.1 days (95% CI, 13.3-27.0) and sMAPE by 2.37 percentage points (95% CI, 1.81-2.93), while discrimination and endpoint-ranking differences were inconclusive. Corrected RND showed low tail agreement with the primary score (Spearman rho = 0.430; q90 Jaccard = 0.125) despite a similar aggregate timing association. These findings support representation-aware, uncertainty-aware literature-relative prioritization of discovered trajectories rather than causal discovery or clinician-adjudicated novelty.
- Abstract(参考訳): 電子健康記録(EHR)のグラフに基づく分析は、疾患の軌跡カタログを生成するが、構造的サポートは意味的新奇性を確立しない。
提案する2段階のフレームワークは,これまで上流の患者分離型MIMIC-IV v3.1パイプラインで検出されていた99,527個の分岐モチーフを優先し,検証に基づくカタログ選択後に凍結する。
このフレームワークは、パスレベルとノード間セマンティックスを信頼性調整された臨床上の優先度から分離する。
3つの決定論的テキスト化をBAAI/bge-small-en-v1.5に埋め込み,平均トップ20コサイン距離を用いて166,972個のPubMed参照を校正した。
正の組換えはモチーフの8.63%で発生し、グローバルランキングに無視できる効果を示したが、特異性とサポート/GNN信頼性の条件は臨床優先の順序を変えた。
近隣のカウント、テンプレート、エンコーダ、ジェネリックラベル分類、スコア設定、プライムKG、修正された密度ベースRNDのロバストネス解析により、広順序化はハードトップkのメンバーシップよりも安定していることが示された。
意味量分析は、エンドポイントとトークン数調整後のスコアと予測利益(SDあたり1.96日、95% CI、-0.75から4.68)の単調な関係をサポートしなかった。
凍結されたカタログ-q90ハイセマンティックサブグループでは、分岐強化予測により条件付きイベントタイムMAEが20.1日(95% CI, 13.3-27.0)、sMAPEが2.37ポイント(95% CI, 1.81-2.93)減少し、識別とエンドポイントレベルの差は決定的ではなかった。
修正されたRNDは、同様の集計タイミングの関連にもかかわらず、一次スコア(Spearman rho = 0.430; q90 Jaccard = 0.125)と低い尾の一致を示した。
これらの知見は, 因果的発見や臨床適応的ノベルティよりも, 発見された軌跡の表現的, 不確実性を考慮した文献的相対的優先順位付けを支持した。
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