論文の概要: CellTrack-Bench: Microscopic Cell Tracking Benchmark for Vision-Language Models
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2610.31566v1
- Date: Thu, 22 Oct 2026 17:09:12 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-10-24 02:08:44.490257
- Title: CellTrack-Bench: Microscopic Cell Tracking Benchmark for Vision-Language Models
- Title(参考訳): CellTrack-Bench:視覚言語モデルのための顕微鏡細胞追跡ベンチマーク
- Abstract要約: 大規模言語モデルは、コーディング、数学、書き込みといったテキスト優先のタスクで優れたパフォーマンスを示している。
近年の取り組みは、テキスト以外の高度に専門化された領域にしばしば存在する科学的問題を含むように、モデルのトレーニングをシフトさせている。
これを評価するため、我々は新しいベンチマークCellTrack-Benchを作成し、Vision-Language Modelsの細胞追跡関連性能を評価する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 1.3356260369011272
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
- Abstract: Large language models have shown outstanding performance on text-first tasks such as coding, math, and writing. Recent efforts are shifting models' training to include scientific problems that often live in highly specialized domains beyond text, such as protein structure and biological images. However, in these scenarios, their general-purpose accuracy compared with specialized algorithms remains in question. One such domain is cell tracking, which requires spatiotemporal awareness of cell dynamics. To evaluate this, we created a new benchmark, CellTrack-Bench, which assesses Vision-Language Models' (VLMs) cell-tracking-related performance against specialized trackers. The full benchmark draws from 15 standard cell-tracking datasets across four imaging modalities and comprises 1,537 problems corresponding to 9,041 cell-linking decisions. We selected a hard subset requiring greater reasoning effort by identifying failures shared across distinct algorithmic trackers. With this proposed dataset, we: (i) evaluated different environment harnesses for VLMs; (ii) benchmarked 9 frontier closed-source models and 13 open-weight models; and (iii) provided a detailed analysis of their failure modes. Code, the stored model outputs, and a pipeline that regenerates the benchmark from the source datasets are available at https://github.com/royerlab/celltrack-bench.
- Abstract(参考訳): 大規模言語モデルは、コーディング、数学、書き込みといったテキスト優先のタスクで優れたパフォーマンスを示している。
近年の取り組みは、タンパク質構造や生物学的画像など、テキスト以外の高度に専門化された領域にしばしば存在する科学的な問題を含むように、モデルのトレーニングをシフトさせている。
しかし、これらのシナリオでは、特殊アルゴリズムと比較して汎用的な精度が疑問視されている。
そのようなドメインの1つは細胞追跡であり、細胞動態の時空間的認識を必要とする。
そこで我々は,VLM(Vision-Language Models)細胞追跡関連性能を特殊なトラッカーに対して評価するベンチマークCellTrack-Benchを開発した。
完全なベンチマークは、4つの画像モダリティにわたる15の標準的なセル追跡データセットから作成され、9,041のセルリンク決定に対応する1,537の問題を解決する。
我々は、異なるアルゴリズムトラッカー間で共有される障害を特定することによって、より深い推論作業を必要とするハードサブセットを選択した。
この提案されたデータセットでは、以下のとおりです。
(i)VLMの異なる環境ハーネスの評価
(ii)9つのフロンティアクローズドソースモデルと13個のオープンウェイトモデルをベンチマークした。
(iii) 障害モードの詳細な分析を行った。
コード、ストアドモデル出力、ソースデータセットからベンチマークを再生するパイプラインはhttps://github.com/royerlab/celltrack-bench.orgで公開されている。
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