論文の概要: Do Language Models Know What Compelling Scientific Evidence Looks Like?
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2610.41015v1
- Date: Thu, 29 Oct 2026 21:51:23 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-11-02 22:05:31.502824
- Title: Do Language Models Know What Compelling Scientific Evidence Looks Like?
- Title(参考訳): 言語モデルは科学的証拠をどう解釈するか?
- Abstract要約: 3つの生物学的領域における実世界のデータから算出した科学的推論ベンチマークである-Bioを紹介した。
ビオの96kエピソードの各エピソードは、出版された研究から実験結果を示し、ターゲット仮説が真である確率を予測するようモデルに求める。
厳格な適切なスコアリングルールに対するポストトレーニングは、校正と差別の両方を著しく改善する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 4.369786192432518
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Expert scientists excel at weighing empirical findings from multiple sources that vary in both statistical reliability and epistemic relevance. To what extent are language models, which are increasingly driving autonomous discovery systems, capable of such evidence deliberation? We introduce EDB-Bio, a scientific reasoning benchmark curated from real-world data in three biological domains: drug-perturbation transcriptomics, CRISPR screens, and human genome-wide association studies (GWAS). Each of EDB-Bio's 96k episodes presents a sequence of experimental results from published studies and asks the model to predict the probability that a target hypothesis is true. Out-of-the-box, open-weight and frontier models alike demonstrate systematic underconfidence and attain Brier scores comparable to a trivial base-rate forecaster. Post-training against strictly proper scoring rules significantly improves both calibration and discrimination. This calibration pays off downstream: in a sequential experiment selection task, our Ibis0 model is 2.5 times more efficient than the best frontier model. Throughout, quantifying evidence weights as Bayes factors reveals how models update their beliefs over time, whether they agree with expert biologists on relevance, and where they exhibit inconsistencies and biases. Our work extends calibration training and uncertainty analysis to a realistic scientific forecasting setting with applications to human cancer biology. We release all code, data, and trained models.
- Abstract(参考訳): 専門家は、統計的信頼性とてんかんの関連性の両方が異なる複数の情報源からの経験的発見を測ることに長けている。
自律的な発見システムをますます推進している言語モデルは、どの程度まで、そのような証拠を検討できるのだろうか?
EDB-Bioは3つの生物領域(薬物摂動転写学、CRISPRスクリーン、ヒトゲノムワイド・アソシエーション研究(GWAS))における実世界のデータから算出された科学的推論ベンチマークである。
EDB-Bioの96kエピソードはそれぞれ、出版された研究から実験結果の連続を示し、ターゲット仮説が真である確率を予測するようモデルに求める。
アウト・オブ・ザ・ボックス、オープンウェイト、フロンティアモデルも同様に、体系的な不信感を示し、ブライアスコアは自明なベースレート予測器に匹敵する。
厳格な適切なスコアリングルールに対するポストトレーニングは、校正と差別の両方を著しく改善する。
連続的な実験選択タスクでは、我々のIbis0モデルは最良のフロンティアモデルよりも2.5倍効率が良い。
ベイズ因子のような証拠の重みの定量化は、モデルが時間の経過とともに信念を更新する方法を明らかにし、専門家生物学者と関連性について合意するか、矛盾や偏見を示すかを明らかにする。
我々の研究はキャリブレーショントレーニングと不確実性分析を拡張し、現実的な科学的予測設定とヒトがん生物学への応用を拡大する。
すべてのコード、データ、トレーニングされたモデルをリリースします。
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