論文の概要: Overview of chemical ontologies
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2002.03842v1
- Date: Fri, 7 Feb 2020 10:42:22 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-01-03 04:43:47.176784
- Title: Overview of chemical ontologies
- Title（参考訳）: 化学オントロジーの概観
- Authors: Christian Pachl, Nils Frank, Jan Breitbart, Stefan Br\"ase
- Abstract要約: オントロジーは形式的かつ意味的な方法である分野の知識を順序付け、相互接続する。
化学分析法に関するオントロジー、名前反応に関するオントロジー、科学単位に関するオントロジーについて述べる。
- 参考スコア（独自算出の注目度）: 0.0
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
- Abstract: Ontologies order and interconnect knowledge of a certain field in a formal
and semantic way so that they are machine-parsable. They try to define allwhere
acceptable definition of concepts and objects, classify them, provide
properties as well as interconnect them with relations (e.g. "A is a special
case of B"). More precisely, Tom Gruber defines Ontologies as a "specification
of a conceptualization; [...] a description (like a formal specification of a
program) of the concepts and relationships that can exist for an agent or a
community of agents." [1] An Ontology is made of Individuals which are
organized in Classes. Both can have Attributes and Relations among themselves.
Some complex Ontologies define Restrictions, Rules and Events which change
attributes or relations. To be computer accessible they are written in certain
ontology languages, like the OBO language or the more used Common Algebraic
Specification Language. With the rising of a digitalized, interconnected and
globalized world, where common standards have to be found, ontologies are of
great interest. [2] Yet, the development of chemical ontologies is in the
beginning. Indeed, some interesting basic approaches towards chemical
ontologies can be found, but nevertheless they suffer from two main flaws.
Firstly, we found that they are mostly only fragmentary completed or are still
in an architecture state. Secondly, apparently no chemical ontology is
widespread accepted. Therefore, we herein try to describe the major
ontology-developments in the chemical related fields Ontologies about chemical
analytical methods, Ontologies about name reactions and Ontologies about
scientific units.
- Abstract（参考訳）: オントロジーは特定の分野の知識を形式的かつ意味的な方法で順序付け、相互接続し、マシンパーザブルである。
彼らは、概念や対象の許容可能な定義を定義し、それらを分類し、特性を提供し、それらを関係と相互接続する(例: "A is a special case of B")。
より正確には、トム・グルーバー(Tom Gruber)はオントロジーを「概念化の特定; [...]エージェントやエージェントのコミュニティに存在可能な概念と関係の(プログラムの正式な仕様のような)記述」と定義している。
どちらも属性と関係を持つことができる。
いくつかの複雑なオントロジは属性や関係を変更する制限、ルール、イベントを定義します。
コンピュータでアクセスできるように、OBO言語やよりよく使われる共通代数仕様言語など、特定のオントロジー言語で書かれている。
共通標準を見つける必要があるデジタル化、相互接続、グローバル化の世界が台頭するにつれ、オントロジーは大きな関心を集めている。
[2] しかし, 化学オントロジーの発展は始まったばかりである。
実際、化学オントロジーに対するいくつかの興味深い基本的なアプローチが見つかるが、2つの主要な欠陥に悩まされている。
まず、それらは大部分が断片的な完成か、あるいはまだアーキテクチャの状態にあることが分かりました。
第二に、化学オントロジーは広く受け入れられていない。
そこで本研究では,化学関連分野における化学分析法に関するオントロジー,名称反応に関するオントロジー,科学単位に関するオントロジーについて述べる。
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