論文の概要: ACEnet: Anatomical Context-Encoding Network for Neuroanatomy
Segmentation
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2002.05773v3
- Date: Sat, 2 Jan 2021 22:30:59 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-01-01 13:39:54.492784
- Title: ACEnet: Anatomical Context-Encoding Network for Neuroanatomy
Segmentation
- Title(参考訳): acenet:神経解剖学セグメンテーションのための解剖学的コンテキストエンコーディングネットワーク
- Authors: Yuemeng Li, Hongming Li, Yong Fan
- Abstract要約: 2次元深層学習法はその計算効率に好適である。
既存の2次元深層学習法では、3次元空間的情報を効果的に捉えることができない。
我々は2次元畳み込みニューラルネットワーク(CNN)に3次元空間および解剖コンテキストを組み込む解剖コンテキストネットワーク(ACEnet)を開発した。
提案手法は,脳構造セグメンテーションにおける最先端の代替手法と比較して,有望な性能を実現する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 1.7080853582489066
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Segmentation of brain structures from magnetic resonance (MR) scans plays an
important role in the quantification of brain morphology. Since 3D deep
learning models suffer from high computational cost, 2D deep learning methods
are favored for their computational efficiency. However, existing 2D deep
learning methods are not equipped to effectively capture 3D spatial contextual
information that is needed to achieve accurate brain structure segmentation. In
order to overcome this limitation, we develop an Anatomical Context-Encoding
Network (ACEnet) to incorporate 3D spatial and anatomical contexts in 2D
convolutional neural networks (CNNs) for efficient and accurate segmentation of
brain structures from MR scans, consisting of 1) an anatomical context encoding
module to incorporate anatomical information in 2D CNNs and 2) a spatial
context encoding module to integrate 3D image information in 2D CNNs. In
addition, a skull stripping module is adopted to guide the 2D CNNs to attend to
the brain. Extensive experiments on three benchmark datasets have demonstrated
that our method achieves promising performance compared with state-of-the-art
alternative methods for brain structure segmentation in terms of both
computational efficiency and segmentation accuracy.
- Abstract(参考訳): 磁気共鳴(MR)スキャンによる脳構造の分離は、脳形態の定量化において重要な役割を果たす。
3次元深層学習モデルは計算コストが高いため、2次元深層学習法はその計算効率に好適である。
しかし、既存の2次元深層学習法では、正確な脳構造セグメンテーションを実現するために必要な3次元空間文脈情報を効果的に捉えることができない。
この制限を克服するために、MRスキャンから脳構造の効率的かつ正確なセグメンテーションを行うために、2次元畳み込みニューラルネットワーク(CNN)に3次元空間的および解剖学的コンテキストを組み込む、ACEnet(Anatomical Context-Encoding Network)を開発した。
1)2次元CNNに解剖情報を組み込む解剖学的文脈符号化モジュール及び
2)2次元CNNに3次元画像情報を統合する空間コンテキスト符号化モジュール。
さらに、脳への2D CNNを誘導するために頭蓋骨剥離モジュールが採用されている。
3つのベンチマークデータセットの大規模な実験により、計算効率とセグメンテーション精度の両面から、脳構造セグメンテーションの最先端の代替手法と比較して有望な性能が得られることを示した。
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