論文の概要: Deep Object Detection based Mitosis Analysis in Breast Cancer
Histopathological Images
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2003.08803v1
- Date: Tue, 17 Mar 2020 00:51:16 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-12-22 20:29:02.925783
- Title: Deep Object Detection based Mitosis Analysis in Breast Cancer
Histopathological Images
- Title(参考訳): 深達度検出に基づく乳癌組織像の組織学的解析
- Authors: Anabia Sohail, Muhammad Ahsan Mukhtar, Asifullah Khan, Muhammad Mohsin
Zafar, Aneela Zameer, Saranjam Khan
- Abstract要約: 提案モデルの性能は, TUPAC16データセット上の2段階検出モデル(Fスコア0.701)と比較して, 有意な精度(0.86)を有する有糸分裂核の識別能力の向上(Fスコア0.86)を示す。
実験結果から, 深部物体検出に基づくモデルでは, 弱い注釈付きデータから有糸分裂核の特徴を学習できる可能性が示唆された。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.24466725954625884
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Empirical evaluation of breast tissue biopsies for mitotic nuclei detection
is considered an important prognostic biomarker in tumor grading and cancer
progression. However, automated mitotic nuclei detection poses several
challenges because of the unavailability of pixel-level annotations, different
morphological configurations of mitotic nuclei, their sparse representation,
and close resemblance with non-mitotic nuclei. These challenges undermine the
precision of the automated detection model and thus make detection difficult in
a single phase. This work proposes an end-to-end detection system for mitotic
nuclei identification in breast cancer histopathological images. Deep object
detection-based Mask R-CNN is adapted for mitotic nuclei detection that
initially selects the candidate mitotic region with maximum recall. However, in
the second phase, these candidate regions are refined by multi-object loss
function to improve the precision. The performance of the proposed detection
model shows improved discrimination ability (F-score of 0.86) for mitotic
nuclei with significant precision (0.86) as compared to the two-stage detection
models (F-score of 0.701) on TUPAC16 dataset. Promising results suggest that
the deep object detection-based model has the potential to learn the
characteristic features of mitotic nuclei from weakly annotated data and
suggests that it can be adapted for the identification of other nuclear bodies
in histopathological images.
- Abstract(参考訳): 子宮内膜核検出のための乳腺組織生検の実験的評価は,腫瘍グレーディングや癌進行において重要な予後指標であると考えられる。
しかし、自動ミオティック核検出は、ピクセルレベルのアノテーションが利用できないこと、ミオティック核の異なる形態構成、そのスパース表現、非ミオティック核との密接な類似性など、いくつかの問題を引き起こす。
これらの課題は、自動検出モデルの精度を損なうため、単一フェーズでの検出が困難になる。
本研究は乳癌組織像におけるミトコンドリア核同定のためのエンドツーエンド検出システムを提案する。
ディープオブジェクト検出に基づくMask R-CNNは、最初は最大リコールで候補ミトティック領域を選択するミトティック核検出に適応する。
しかし、第2段階では、これらの候補領域は、精度を向上させるために多目的損失関数によって洗練される。
提案モデルの性能は, TUPAC16データセット上の2段階検出モデル(Fスコア0.701)と比較して, 有意な精度(0.86)を有する有糸分裂核の識別能力の向上(Fスコア0.86)を示す。
有望な結果は、深部物体検出に基づくモデルが弱い注釈データから分裂核の特徴を学習する可能性を示唆し、病理組織学的画像における他の核体の同定に適応できることを示唆している。
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