論文の概要: Microvasculature Segmentation and Inter-capillary Area Quantification of
the Deep Vascular Complex using Transfer Learning
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2003.09033v1
- Date: Thu, 19 Mar 2020 22:27:02 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-12-22 04:05:20.140068
- Title: Microvasculature Segmentation and Inter-capillary Area Quantification of
the Deep Vascular Complex using Transfer Learning
- Title(参考訳): トランスファーラーニングを用いた深部血管複合体の微小血管分割と毛細血管間領域定量
- Authors: Julian Lo (1), Morgan Heisler (1), Vinicius Vanzan (2), Sonja Karst (2
and 3), Ivana Zadro Matovinovic (4), Sven Loncaric (4), Eduardo V. Navajas
(2), Mirza Faisal Beg (1), Marinko V. Sarunic (1) ((1) School of Engineering
Science, Simon Fraser University, Canada, (2) Department of Ophthalmology and
Visual Sciences, University of British Columbia, Canada, (3) Department of
Ophthalmology and Optometry, Medical University of Vienna, Austria, (4)
Faculty of Electrical Engineering and Computing, University of Zagreb,
Croatia)
- Abstract要約: 畳み込みニューラルネットワーク(CNN)を用いて表面表層血管複合体と深部血管叢の正確なセグメンテーションを定量的に検討した。
異なる OCT システムを用いて取得した SCP の小さい FOV から 76 個の画像で訓練した CNN からの移動学習を応用した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
- Abstract: Purpose: Optical Coherence Tomography Angiography (OCT-A) permits
visualization of the changes to the retinal circulation due to diabetic
retinopathy (DR), a microvascular complication of diabetes. We demonstrate
accurate segmentation of the vascular morphology for the superficial capillary
plexus and deep vascular complex (SCP and DVC) using a convolutional neural
network (CNN) for quantitative analysis.
Methods: Retinal OCT-A with a 6x6mm field of view (FOV) were acquired using a
Zeiss PlexElite. Multiple-volume acquisition and averaging enhanced the vessel
network contrast used for training the CNN. We used transfer learning from a
CNN trained on 76 images from smaller FOVs of the SCP acquired using different
OCT systems. Quantitative analysis of perfusion was performed on the automated
vessel segmentations in representative patients with DR.
Results: The automated segmentations of the OCT-A images maintained the
hierarchical branching and lobular morphologies of the SCP and DVC,
respectively. The network segmented the SCP with an accuracy of 0.8599, and a
Dice index of 0.8618. For the DVC, the accuracy was 0.7986, and the Dice index
was 0.8139. The inter-rater comparisons for the SCP had an accuracy and Dice
index of 0.8300 and 0.6700, respectively, and 0.6874 and 0.7416 for the DVC.
Conclusions: Transfer learning reduces the amount of manually-annotated
images required, while producing high quality automatic segmentations of the
SCP and DVC. Using high quality training data preserves the characteristic
appearance of the capillary networks in each layer.
Translational Relevance: Accurate retinal microvasculature segmentation with
the CNN results in improved perfusion analysis in diabetic retinopathy.
- Abstract(参考訳): 目的: optic coherence tomography angiography (oct-a) は糖尿病の微小血管合併症である糖尿病網膜症(dr)による網膜循環の変化の可視化を可能にする。
表在性毛細血管叢および深部血管複合体(SCP, DVC)に対する, 畳み込みニューラルネットワーク(CNN)による定量的解析により, 血管形態の正確なセグメンテーションを実証した。
方法: zeiss plexeliteを用いて6×6mm視野(fov)の網膜oct-aを得た。
多量獲得と平均化により、cnnの訓練に使用される血管網のコントラストが向上した。
異なる OCT システムを用いて取得した SCP の小さい FOV から 76 個の画像で訓練した CNN からの移動学習を用いた。
結果: OCT-A画像の自動分画はSCPおよびDVCの階層的分岐と葉状形態をそれぞれ維持した。
ネットワークはSCPを0.8599、Dice indexは0.8618で分割した。
dvcの精度は 0.7986 であり, dice 指数は 0.8139 であった。
scpのレート間比較では、それぞれ0.8300と0.6700で、dvcでは 0.6874 と 0.7416 であった。
結論: 転送学習は,SCPとDVCの高品質な自動セグメンテーションを生成しながら,手動で注釈付けした画像の量を減少させる。
高品質なトレーニングデータを使用することで、各層におけるキャピラリーネットワークの特徴的外観が保たれる。
翻訳関連性:CNNによる正確な網膜微小血管分画は糖尿病網膜症における灌流解析の改善をもたらす。
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