論文の概要: Automated segmentation of retinal fluid volumes from structural and
angiographic optical coherence tomography using deep learning
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2006.02569v1
- Date: Wed, 3 Jun 2020 22:55:47 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-11-25 18:29:41.957995
- Title: Automated segmentation of retinal fluid volumes from structural and
angiographic optical coherence tomography using deep learning
- Title(参考訳): 深層学習を用いた構造および血管造影光コヒーレンストモグラフィによる網膜液量の自動分画
- Authors: Yukun Guo, Tristan T. Hormel, Honglian Xiong, Jie Wang, Thomas S.
Hwang, Yali Jia
- Abstract要約: 我々は,光コヒーレンストモグラフィー(OCT)ボリュームで網膜液を分画するための,網膜流体ネットワーク(ReF-Net)と呼ばれる深部畳み込みニューラルネットワーク(CNN)を提案した。
ReF-Netの訓練と試験には断面CTと血管造影(OCTA)スキャンが用いられた。
ReF-Netは網膜液分画において高い精度(F1 = 0.864 +/-0.084)を示す。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 2.041049231600541
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Purpose: We proposed a deep convolutional neural network (CNN), named Retinal
Fluid Segmentation Network (ReF-Net) to segment volumetric retinal fluid on
optical coherence tomography (OCT) volume. Methods: 3 x 3-mm OCT scans were
acquired on one eye by a 70-kHz OCT commercial AngioVue system (RTVue-XR;
Optovue, Inc.) from 51 participants in a clinical diabetic retinopathy (DR)
study (45 with retinal edema and 6 healthy controls). A CNN with U-Net-like
architecture was constructed to detect and segment the retinal fluid.
Cross-sectional OCT and angiography (OCTA) scans were used for training and
testing ReF-Net. The effect of including OCTA data for retinal fluid
segmentation was investigated in this study. Volumetric retinal fluid can be
constructed using the output of ReF-Net.
Area-under-Receiver-Operating-Characteristic-curve (AROC),
intersection-over-union (IoU), and F1-score were calculated to evaluate the
performance of ReF-Net. Results: ReF-Net shows high accuracy (F1 = 0.864 +/-
0.084) in retinal fluid segmentation. The performance can be further improved
(F1 = 0.892 +/- 0.038) by including information from both OCTA and structural
OCT. ReF-Net also shows strong robustness to shadow artifacts. Volumetric
retinal fluid can provide more comprehensive information than the 2D area,
whether cross-sectional or en face projections. Conclusions: A
deep-learning-based method can accurately segment retinal fluid volumetrically
on OCT/OCTA scans with strong robustness to shadow artifacts. OCTA data can
improve retinal fluid segmentation. Volumetric representations of retinal fluid
are superior to 2D projections. Translational Relevance: Using a deep learning
method to segment retinal fluid volumetrically has the potential to improve the
diagnostic accuracy of diabetic macular edema by OCT systems.
- Abstract(参考訳): 目的:光コヒーレンストモグラフィ(oct)ボリュームで体積性網膜液をセグメント化する網膜流体セグメンテーションネットワーク(ref-net)という深層畳み込みニューラルネットワーク(cnn)を提案した。
方法: 臨床糖尿病網膜症(DR)研究51名(網膜浮腫45例,健常6例)から70kHz OCT商用アンジオビューシステム(RTVue-XR; Optovue, Inc.)を用いて3×3mm OCTスキャンを片眼で取得した。
U-Netのような構造を持つCNNが構築され、網膜液の検出と分画が行われた。
ReF-Netの訓練と試験には断面CTと血管造影(OCTA)スキャンが用いられた。
本研究では,OCTAデータを含む網膜液分画の影響について検討した。
容積網膜液はReF-Netの出力を用いて構築することができる。
エリア・アンダー・レシーバー・オペレーティング・キャラクタリスティック・カーブ(AROC), 交差点・オーバー・ユニオン(IoU), F1スコアを算出し, ReF-Netの性能評価を行った。
結果: ReF-Netは網膜液分画において高い精度(F1 = 0.864 +/0.084)を示した。
F1 = 0.892 +/- 0.038) はOCTAと構造OCTの両方からの情報を含むことでさらに改善できる。
ReF-Netはまた、シャドーアーティファクトに対して強い堅牢性を示している。
容積網膜液は2次元領域よりも包括的な情報を提供することができる。
結論: 深層学習に基づく手法では,OCT/OCTAスキャンで網膜液を定量的に分画することができる。
OCTAデータは網膜流体セグメンテーションを改善することができる。
網膜液の体積表現は2次元投影よりも優れている。
翻訳関連性: 深層学習法を用いて網膜液を体積的に分画し, OCTシステムによる糖尿病性黄斑浮腫の診断精度を向上させる可能性がある。
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