論文の概要: Predicting molecular dipole moments by combining atomic partial charges
and atomic dipoles
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2003.12437v3
- Date: Wed, 3 Jun 2020 17:31:23 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-12-19 05:29:24.276719
- Title: Predicting molecular dipole moments by combining atomic partial charges
and atomic dipoles
- Title(参考訳): 原子部分電荷と原子双極子を組み合わせた分子双極子モーメントの予測
- Authors: Max Veit, David M. Wilkins, Yang Yang, Robert A. DiStasio Jr., Michele
Ceriotti
- Abstract要約: 高レベル結合クラスター理論を用いて計算した分子$boldsymbolmu$を再現するために、「MuML」モデルが組み合わされた。
校正委員会モデルを用いて予測の不確かさを確実に推定できることを実証する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 3.0980025155565376
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: The molecular dipole moment ($\boldsymbol{\mu}$) is a central quantity in
chemistry. It is essential in predicting infrared and sum-frequency generation
spectra, as well as induction and long-range electrostatic interactions.
Furthermore, it can be extracted directly from high-level quantum mechanical
calculations, making it an ideal target for machine learning (ML). In this
work, we choose to represent this quantity with a physically inspired ML model
that captures two distinct physical effects: local atomic polarization is
captured within the symmetry-adapted Gaussian process regression (SA-GPR)
framework, which assigns a (vector) dipole moment to each atom, while movement
of charge across the entire molecule is captured by assigning a partial
(scalar) charge to each atom. The resulting "MuML" models are fitted together
to reproduce molecular $\boldsymbol{\mu}$ computed using high-level
coupled-cluster theory (CCSD) and density functional theory (DFT) on the QM7b
dataset. The combined model shows excellent transferability when applied to a
showcase dataset of larger and more complex molecules, approaching the accuracy
of DFT at a small fraction of the computational cost. We also demonstrate that
the uncertainty in the predictions can be estimated reliably using a calibrated
committee model. The ultimate performance of the models depends, however, on
the details of the system at hand, with the scalar model being clearly superior
when describing large molecules whose dipole is almost entirely generated by
charge separation. These observations point to the importance of simultaneously
accounting for the local and non-local effects that contribute to
$\boldsymbol{\mu}$; further, they define a challenging task to benchmark future
models, particularly those aimed at the description of condensed phases.
- Abstract(参考訳): 分子双極子モーメント(分子双極子モーメント、英: molecular dipole moment)は、化学の中心的な量である。
誘導および長距離静電相互作用と同様に、赤外および周波発生スペクトルの予測には不可欠である。
さらに、高レベルの量子力学計算から直接抽出することができ、機械学習(ML)の理想的なターゲットとなる。
局所原子分極は、各原子に(ベクトル)双極子モーメントを割り当てる対称性に適合したガウス過程回帰(sa-gpr)フレームワーク内でキャプチャされ、分子全体の電荷移動は各原子に部分(スカラー)電荷を割り当てることでキャプチャされる。
結果として得られた「MuML」モデルは、QM7bデータセット上の高レベル結合クラスタ理論(CCSD)と密度汎関数理論(DFT)を用いて計算された分子$\boldsymbol{\mu}$を再現する。
組み合わせモデルは、より大きく複雑な分子のショーケースデータセットに適用した場合に優れた転送可能性を示し、計算コストのごく一部でDFTの精度にアプローチする。
また, 予測の不確実性は, 校正委員会モデルを用いて確実に推定できることを示した。
しかし、モデルの最終的な性能は系の詳細に依存し、スカラーモデルは電荷分離によってほぼ完全に生成される大きな分子を記述する際に明らかに優れている。
これらの観察は、$\boldsymbol{\mu}$ に寄与する局所的および非局所的効果を同時に計算することが重要であることを示している。
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