論文の概要: An Auto-Encoder Strategy for Adaptive Image Segmentation
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2004.13903v1
- Date: Wed, 29 Apr 2020 00:53:24 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-12-08 14:29:54.050399
- Title: An Auto-Encoder Strategy for Adaptive Image Segmentation
- Title(参考訳): 適応画像分割のためのオートエンコーダ戦略
- Authors: Evan M. Yu, Juan Eugenio Iglesias, Adrian V. Dalca, Mert R. Sabuncu
- Abstract要約: 本稿では,離散表現学習問題としてセグメンテーションの新たな視点を提案する。
フレキシブルで適応的な自動エンコーダセグメンテーション戦略を提案する。
我々はマルコフランダム場先行が空間的に独立な先行よりもはるかに優れた結果が得られることを示した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 18.333542893112007
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Deep neural networks are powerful tools for biomedical image segmentation.
These models are often trained with heavy supervision, relying on pairs of
images and corresponding voxel-level labels. However, obtaining segmentations
of anatomical regions on a large number of cases can be prohibitively
expensive. Thus there is a strong need for deep learning-based segmentation
tools that do not require heavy supervision and can continuously adapt. In this
paper, we propose a novel perspective of segmentation as a discrete
representation learning problem, and present a variational autoencoder
segmentation strategy that is flexible and adaptive. Our method, called
Segmentation Auto-Encoder (SAE), leverages all available unlabeled scans and
merely requires a segmentation prior, which can be a single unpaired
segmentation image. In experiments, we apply SAE to brain MRI scans. Our
results show that SAE can produce good quality segmentations, particularly when
the prior is good. We demonstrate that a Markov Random Field prior can yield
significantly better results than a spatially independent prior. Our code is
freely available at https://github.com/evanmy/sae.
- Abstract(参考訳): ディープニューラルネットワークは、バイオメディカルイメージセグメンテーションの強力なツールである。
これらのモデルは、しばしば、画像のペアと対応するボクセルレベルのラベルに依存して、重い監督で訓練される。
しかし、多くのケースで解剖学的領域のセグメント化を得ることは、非常に高価である。
したがって、深層学習に基づくセグメンテーションツールには、大量の監督を必要としない、継続的に適応できる強いニーズがある。
本稿では,離散表現学習問題としてのセグメンテーションの新しい展望を提案し,柔軟かつ適応的な変分オートエンコーダセグメンテーション戦略を提案する。
我々の手法は、SAE(Segmentation Auto-Encoder)と呼ばれ、利用可能なすべての未ラベルのスキャンを活用し、単に1つの未ペアのセグメンテーションイメージであるセグメンテーション前を必要とするだけである。
実験では、脳MRIスキャンにSAEを適用した。
以上の結果から,SAEは品質のよいセグメンテーションを生成できることが示唆された。
マルコフ確率場前駆は空間的に独立な前駆体よりもはるかに良い結果が得られることを示す。
私たちのコードはhttps://github.com/evanmy/saeで無料で利用できます。
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