論文の概要: Computing Absolute Free Energy with Deep Generative Models
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2005.00638v2
- Date: Mon, 31 Aug 2020 21:48:52 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-12-08 00:30:15.939993
- Title: Computing Absolute Free Energy with Deep Generative Models
- Title(参考訳): 深部生成モデルによる絶対自由エネルギーの計算
- Authors: Xinqiang Ding and Bin Zhang
- Abstract要約: 状態の絶対自由エネルギーを計算するための一般的な枠組みを導入する。
計算の重要なステップは、抽出可能な深層生成モデルによる参照状態の定義である。
興味のある状態に対する自由エネルギーは、参照との違いとして決定することができる。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 2.610895122644814
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Fast and accurate evaluation of free energy has broad applications from drug
design to material engineering. Computing the absolute free energy is of
particular interest since it allows the assessment of the relative stability
between states without the use of intermediates. In this letter, we introduce a
general framework for calculating the absolute free energy of a state. A key
step of the calculation is the definition of a reference state with tractable
deep generative models using locally sampled configurations. The absolute free
energy of this reference state is zero by design. The free energy for the state
of interest can then be determined as the difference from the reference. We
applied this approach to both discrete and continuous systems and demonstrated
its effectiveness. It was found that the Bennett acceptance ratio method
provides more accurate and efficient free energy estimations than approximate
expressions based on work. We anticipate the method presented here to be a
valuable strategy for computing free energy differences.
- Abstract(参考訳): 自由エネルギーの迅速かつ正確な評価は、医薬品設計から材料工学まで幅広い応用がある。
絶対自由エネルギーの計算は、中間体を使わずに状態間の相対安定性を評価することができるため、特に興味深い。
本稿では,状態の絶対自由エネルギーを計算するための一般的な枠組みを提案する。
計算の鍵となるステップは、局所的なサンプル構成を用いた抽出可能な深層生成モデルによる参照状態の定義である。
この参照状態の絶対自由エネルギーは設計によりゼロである。
興味のある状態に対する自由エネルギーは、参照との違いとして決定することができる。
このアプローチを離散システムと連続システムの両方に適用し,その効果を実証した。
ベネット受入比法は作業に基づく近似式よりも正確で効率的な自由エネルギー推定を提供することがわかった。
本手法は,自由エネルギー差を計算する上で有用な戦略であると考えられる。
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