論文の概要: Deep Learning and Bayesian Deep Learning Based Gender Prediction in
Multi-Scale Brain Functional Connectivity
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2005.08431v1
- Date: Mon, 18 May 2020 02:43:26 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-12-01 22:44:49.303289
- Title: Deep Learning and Bayesian Deep Learning Based Gender Prediction in
Multi-Scale Brain Functional Connectivity
- Title(参考訳): マルチスケール脳機能接続における深層学習とベイズ型深層学習に基づく性予測
- Authors: Gengyan Zhao, Gyujoon Hwang, Cole J. Cook, Fang Liu, Mary E. Meyerand
and Rasmus M. Birn
- Abstract要約: 脳機能接続(FC)から性別を予測することは、脳の活動と性別の関係を構築することができる。
性別予測に適用された現在の予測モデルは、良好な精度を示す。
本稿では,複数スケールの脳内FCの性別をディープラーニングで予測し,完全なFCパターンを特徴として抽出する手法を提案する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 2.2182171526013774
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Brain gender differences have been known for a long time and are the possible
reason for many psychological, psychiatric and behavioral differences between
males and females. Predicting genders from brain functional connectivity (FC)
can build the relationship between brain activities and gender, and extracting
important gender related FC features from the prediction model offers a way to
investigate the brain gender difference. Current predictive models applied to
gender prediction demonstrate good accuracies, but usually extract individual
functional connections instead of connectivity patterns in the whole
connectivity matrix as features. In addition, current models often omit the
effect of the input brain FC scale on prediction and cannot give any model
uncertainty information. Hence, in this study we propose to predict gender from
multiple scales of brain FC with deep learning, which can extract full FC
patterns as features. We further develop the understanding of the feature
extraction mechanism in deep neural network (DNN) and propose a DNN feature
ranking method to extract the highly important features based on their
contributions to the prediction. Moreover, we apply Bayesian deep learning to
the brain FC gender prediction, which as a probabilistic model can not only
make accurate predictions but also generate model uncertainty for each
prediction. Experiments were done on the high-quality Human Connectome Project
S1200 release dataset comprising the resting state functional MRI data of 1003
healthy adults. First, DNN reaches 83.0%, 87.6%, 92.0%, 93.5% and 94.1%
accuracies respectively with the FC input derived from 25, 50, 100, 200, 300
independent component analysis (ICA) components. DNN outperforms the
conventional machine learning methods on the 25-ICA-component scale FC, but the
linear machine learning method catches up as the number of ICA components
increases...
- Abstract(参考訳): 脳の性別差は長い間知られており、男性と女性の間に多くの心理的、精神学的、行動的な違いがある可能性がある。
脳機能接続(FC)から性別を予測することは、脳の活動と性別の関係を構築し、予測モデルから重要な性別関連FC特徴を抽出することで、脳の性別差を調査する方法を提供する。
性予測に適用された現在の予測モデルでは、良好な精度を示すが、接続マトリックス全体の接続パターンではなく、個々の機能的な接続を特徴として抽出する。
さらに、現在のモデルは入力脳のfcスケールが予測に与える影響を省略し、モデルの不確実性情報を与えることができないことが多い。
そこで本研究では,深層学習を用いた複数スケールの脳内FCから,完全なFCパターンを特徴として抽出できるジェンダーを予測することを提案する。
深層ニューラルネットワーク(DNN)における特徴抽出機構の理解を深め,その予測への貢献に基づいて重要な特徴を抽出するDNN特徴ランキング法を提案する。
さらに,確率モデルとして正確な予測を行うことができるだけでなく,予測毎にモデルの不確実性を生成する脳fc性予測にもベイズ深層学習を適用する。
高品質なHuman Connectome Project S1200リリースデータセット上で、1003人の健常成人の静止状態機能MRIデータを含む実験を行った。
まず、DNNは、それぞれ25,50,100,200,300の独立成分分析(ICA)成分から得られるFC入力と合わせて83.0%,87.6%,92.0%,93.5%,94.1%の精度に達する。
DNNは25-ICA-component scale FCで従来の機械学習手法より優れているが、ICAコンポーネントの数が増えるにつれて、線形機械学習手法が追いつく。
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