論文の概要: Transferability of coVariance Neural Networks and Application to
Interpretable Brain Age Prediction using Anatomical Features
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2305.01807v2
- Date: Thu, 4 May 2023 23:58:12 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-05-08 16:35:11.072352
- Title: Transferability of coVariance Neural Networks and Application to
Interpretable Brain Age Prediction using Anatomical Features
- Title(参考訳): 共分散ニューラルネットワークの伝達性と解剖学的特徴を用いた脳年齢予測への応用
- Authors: Saurabh Sihag, Gonzalo Mateos, Corey T. McMillan, Alejandro Ribeiro
- Abstract要約: グラフ畳み込みネットワーク(GCN)は、トポロジー駆動のグラフ畳み込み演算を利用して、推論タスクのためにグラフをまたいだ情報を結合する。
我々は、共分散行列をグラフとして、共分散ニューラルネットワーク(VNN)の形でGCNを研究した。
VNNは、GCNからスケールフリーなデータ処理アーキテクチャを継承し、ここでは、共分散行列が極限オブジェクトに収束するデータセットに対して、VNNが性能の転送可能性を示すことを示す。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 119.45320143101381
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Graph convolutional networks (GCN) leverage topology-driven graph
convolutional operations to combine information across the graph for inference
tasks. In our recent work, we have studied GCNs with covariance matrices as
graphs in the form of coVariance neural networks (VNNs) that draw similarities
with traditional PCA-driven data analysis approaches while offering significant
advantages over them. In this paper, we first focus on theoretically
characterizing the transferability of VNNs. The notion of transferability is
motivated from the intuitive expectation that learning models could generalize
to "compatible" datasets (possibly of different dimensionalities) with minimal
effort. VNNs inherit the scale-free data processing architecture from GCNs and
here, we show that VNNs exhibit transferability of performance over datasets
whose covariance matrices converge to a limit object. Multi-scale neuroimaging
datasets enable the study of the brain at multiple scales and hence, can
validate the theoretical results on the transferability of VNNs. To gauge the
advantages offered by VNNs in neuroimaging data analysis, we focus on the task
of "brain age" prediction using cortical thickness features. In clinical
neuroscience, there has been an increased interest in machine learning
algorithms which provide estimates of "brain age" that deviate from
chronological age. We leverage the architecture of VNNs to extend beyond the
coarse metric of brain age gap in Alzheimer's disease (AD) and make two
important observations: (i) VNNs can assign anatomical interpretability to
elevated brain age gap in AD, and (ii) the interpretability offered by VNNs is
contingent on their ability to exploit specific principal components of the
anatomical covariance matrix. We further leverage the transferability of VNNs
to cross validate the above observations across different datasets.
- Abstract(参考訳): グラフ畳み込みネットワーク(gcn)はトポロジー駆動グラフ畳み込み操作を利用して、推論タスクのためにグラフ全体の情報を結合する。
最近の研究では、従来のpca駆動のデータ分析手法と類似性を示しながら、グラフとして共分散行列を用いたgcnを共分散ニューラルネットワーク(vnn)として研究した。
本稿では,VNNの転送可能性について理論的に考察する。
伝達可能性の概念は、学習モデルが最小限の努力で(おそらく異なる次元の)「互換性のある」データセットに一般化できるという直感的な期待から導かれる。
VNNは、GCNからスケールフリーなデータ処理アーキテクチャを継承し、ここでは、共分散行列が極限オブジェクトに収束するデータセットよりも性能の伝達性を示すことを示す。
マルチスケールのニューロイメージングデータセットは、複数のスケールで脳の研究を可能にするため、VNNの伝達可能性に関する理論的結果を検証することができる。
神経画像データ解析におけるVNNの利点を評価するため,大脳皮質の厚み特徴を用いた脳年齢予測の課題に着目した。
臨床神経科学では、年輪年代から逸脱する「脳年齢」の推定を提供する機械学習アルゴリズムへの関心が高まっている。
VNNのアーキテクチャを活用して、アルツハイマー病(AD)の脳年齢ギャップの粗い指標を超えて、2つの重要な観察を行う。
i)VNNはADにおける脳年齢差の増大に解剖学的解釈可能性を与えることができる
(II) 解剖学的共分散行列の特定の主成分を利用する能力にVNNが提供する解釈可能性がある。
さらに、VNNの転送可能性を活用して、上記の観測結果を異なるデータセット間で相互に検証する。
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