論文の概要: Structure-based Hamiltonian model for IsiA uncovers a highly robust
pigment protein complex
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2006.00947v2
- Date: Sun, 9 Aug 2020 07:39:25 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-05-17 11:28:16.347957
- Title: Structure-based Hamiltonian model for IsiA uncovers a highly robust
pigment protein complex
- Title(参考訳): IsiAの構造に基づくハミルトニアンモデルによる高堅牢な色素タンパク質複合体の発見
- Authors: Hanan Schoffman, William M. Brown, Yossi Paltiel, Nir Keren and Erik
M. Gauger
- Abstract要約: 鉄ストレスによって誘導されるタンパク質A(IsiA)は、生物学的研究における興味と議論の源である。
IsiA色素タンパク質複合体のエネルギーは室温で非常に強い。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: The iron stress-induced protein A (IsiA) is a source of interest and debate
in biological research. The IsiA super-complex, binding over 200 chlorophylls,
assembles in multimeric rings around photosystem I (PSI). Recently, the
IsiA-PSI structure was resolved to 3.48 {\AA}. Based on this structure, we
created a model simulating a single excitation event in an IsiA monomer. This
model enabled us to calculate the fluorescence and the localisation of the
excitation in the IsiA structure. To further examine this system, noise was
introduced to the model in two forms -- thermal and positional. Introducing
noise highlights the functional differences in the system between cryogenic
temperatures and biologically relevant temperatures. Our results show that the
energetics of the IsiA pigment-protein complex are very robust at room
temperature. Nevertheless, shifts in the position of specific chlorophylls lead
to large changes in their optical and fluorescence properties. Based on these
results we discuss the implication of highly robust structures, with potential
for serving different roles in a context dependent manner, on our understanding
of the function and evolution of photosynthetic processes.
- Abstract(参考訳): 鉄ストレス誘発タンパク質a(iia)は、生物学的研究における興味と議論の源である。
200以上のクロロフィルを結合するIsiA超複合体は、光系I(PSI)の周りの多量体環に組み立てられる。
近年、IsiA-PSI構造は3.48 {\AA} に分解された。
この構造に基づいて、IsiAモノマー内の単一励起事象をシミュレートするモデルを構築した。
このモデルにより,isia構造における励起の蛍光と局所化の計算が可能となった。
このシステムをさらに検討するため、モデルに熱と位置の2つの形態でノイズを導入した。
騒音の導入は、低温と生物学的に関連する温度のシステムにおける機能的差異を強調している。
以上の結果から,IsiA色素タンパク質複合体のエネルギーは室温では非常に強いことが示唆された。
それでも、特定のクロロフィルの位置の変化は、光学的および蛍光的性質に大きな変化をもたらす。
これらの結果に基づき,光合成過程の機能と進化の理解に基づいて,異なる役割をコンテキストに依存した形で果たす可能性を持つ,高ロバストな構造の含意について考察する。
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