論文の概要: Subgraph Neural Networks
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2006.10538v3
- Date: Fri, 6 Nov 2020 20:56:21 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-11-19 13:33:35.121984
- Title: Subgraph Neural Networks
- Title(参考訳): サブグラフニューラルネットワーク
- Authors: Emily Alsentzer, Samuel G. Finlayson, Michelle M. Li, Marinka Zitnik
- Abstract要約: 本稿では,不整合部分グラフ表現を学習するためのサブグラフニューラルネットワークSubGNNを紹介する。
SubGNNは、挑戦的なバイオメディカルデータセットで非常によく機能する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 14.222887950206662
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Deep learning methods for graphs achieve remarkable performance on many
node-level and graph-level prediction tasks. However, despite the proliferation
of the methods and their success, prevailing Graph Neural Networks (GNNs)
neglect subgraphs, rendering subgraph prediction tasks challenging to tackle in
many impactful applications. Further, subgraph prediction tasks present several
unique challenges: subgraphs can have non-trivial internal topology, but also
carry a notion of position and external connectivity information relative to
the underlying graph in which they exist. Here, we introduce SubGNN, a subgraph
neural network to learn disentangled subgraph representations. We propose a
novel subgraph routing mechanism that propagates neural messages between the
subgraph's components and randomly sampled anchor patches from the underlying
graph, yielding highly accurate subgraph representations. SubGNN specifies
three channels, each designed to capture a distinct aspect of subgraph
topology, and we provide empirical evidence that the channels encode their
intended properties. We design a series of new synthetic and real-world
subgraph datasets. Empirical results for subgraph classification on eight
datasets show that SubGNN achieves considerable performance gains,
outperforming strong baseline methods, including node-level and graph-level
GNNs, by 19.8% over the strongest baseline. SubGNN performs exceptionally well
on challenging biomedical datasets where subgraphs have complex topology and
even comprise multiple disconnected components.
- Abstract(参考訳): グラフの深層学習法は多くのノードレベルおよびグラフレベルの予測タスクにおいて顕著な性能を達成する。
しかし、この手法の普及と成功にもかかわらず、グラフニューラルネットワーク(GNN)はサブグラフを無視し、多くの影響のあるアプリケーションに対処しようとするサブグラフ予測タスクを描画する。
さらに、部分グラフ予測タスクは、非自明な内部トポロジーを持つだけでなく、それらが存在する基礎となるグラフに対する位置および外部接続情報の概念も持つ。
本稿では,不整合部分グラフ表現を学習するためのサブグラフニューラルネットワークSubGNNを紹介する。
本稿では,サブグラフの成分とアンカーパッチをランダムにサンプリングし,高精度なサブグラフ表現を生成する,新しいサブグラフルーティング機構を提案する。
SubGNNは3つのチャネルを指定しており、それぞれがサブグラフトポロジの異なる側面を捉えるように設計されている。
我々は、新しい合成および実世界のサブグラフデータセットを設計する。
8つのデータセットのサブグラフ分類に関する実証的な結果から、SubGNNはノードレベルやグラフレベルのGNNを含む強力なベースライン手法よりも19.8%高いパフォーマンスを達成している。
SubGNNは、サブグラフが複雑なトポロジを持ち、複数の切断されたコンポーネントを構成する、挑戦的なバイオメディカルデータセットで非常によく機能する。
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