論文の概要: Post-DAE: Anatomically Plausible Segmentation via Post-Processing with
Denoising Autoencoders
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2006.13791v1
- Date: Wed, 24 Jun 2020 15:05:03 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-11-17 10:16:35.052031
- Title: Post-DAE: Anatomically Plausible Segmentation via Post-Processing with
Denoising Autoencoders
- Title(参考訳): Post-DAE:Denoising Autoencodersを用いた後処理による解剖学的プラズブルセグメンテーション
- Authors: Agostina J Larrazabal and C\'esar Mart\'inez and Ben Glocker and Enzo
Ferrante
- Abstract要約: Post-DAEは自動エンコーダ (DAE) に基づく後処理法である
本稿では, Post-DAE を用いて, 誤りとノイズのセグメンテーションマスクをいかに改善できるかを示す。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 19.361024564220454
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: We introduce Post-DAE, a post-processing method based on denoising
autoencoders (DAE) to improve the anatomical plausibility of arbitrary
biomedical image segmentation algorithms. Some of the most popular segmentation
methods (e.g. based on convolutional neural networks or random forest
classifiers) incorporate additional post-processing steps to ensure that the
resulting masks fulfill expected connectivity constraints. These methods
operate under the hypothesis that contiguous pixels with similar aspect should
belong to the same class. Even if valid in general, this assumption does not
consider more complex priors like topological restrictions or convexity, which
cannot be easily incorporated into these methods. Post-DAE leverages the latest
developments in manifold learning via denoising autoencoders. First, we learn a
compact and non-linear embedding that represents the space of anatomically
plausible segmentations. Then, given a segmentation mask obtained with an
arbitrary method, we reconstruct its anatomically plausible version by
projecting it onto the learnt manifold. The proposed method is trained using
unpaired segmentation mask, what makes it independent of intensity information
and image modality. We performed experiments in binary and multi-label
segmentation of chest X-ray and cardiac magnetic resonance images. We show how
erroneous and noisy segmentation masks can be improved using Post-DAE. With
almost no additional computation cost, our method brings erroneous
segmentations back to a feasible space.
- Abstract(参考訳): 任意の生物医用画像分割アルゴリズムの解剖学的妥当性を向上させるため,denoising autoencoders (dae) に基づく後処理法であるpost-dae を提案する。
最も一般的なセグメンテーション手法(畳み込みニューラルネットワークやランダムフォレスト分類器など)には、期待された接続性制約を満たすために処理後のステップが追加されている。
これらの方法は、類似のアスペクトを持つ連続画素は同じクラスに属するべきであるという仮説の下で動作する。
一般に有効であっても、この仮定は位相的制限や凸性のようなより複雑な事前事項を考慮せず、これらの手法に容易に組み込むことはできない。
denoising autoencoderを通じて、post-daeは多様体学習の最新の開発を活用する。
まず、解剖学的に可算なセグメンテーションの空間を表すコンパクトで非線形な埋め込みを学ぶ。
そして,任意の手法で得られたセグメンテーションマスクを与えられたとき,その解剖学的に妥当なバージョンを学習多様体に投影して再構築する。
提案手法は,強度情報や画像モダリティに依存しない非ペアセグメンテーションマスクを用いて学習する。
胸部x線および心磁気共鳴画像の2値および複数ラベル分割実験を行った。
本稿では, Post-DAE を用いて, 誤りとノイズのセグメンテーションマスクをいかに改善できるかを示す。
計算コストの増大がほとんどないため,提案手法は誤りなセグメンテーションを実現可能な空間に戻す。
関連論文リスト
- Train-Free Segmentation in MRI with Cubical Persistent Homology [0.0]
トポロジカルデータ解析(TDA)を用いたMRI画像の分割法について述べる。
これは3つのステップで機能し、まずは自動しきい値設定によってオブジェクト全体をセグメントに識別し、次に事前にトポロジが知られている特定の部分集合を検出し、最後にセグメンテーションの様々な成分を推論する。
脳MRIにおけるグリオブラスト腫分画の例について検討し、2次元スライスが円である胎児脳MRIにおいて、シリンダーを含む心臓MRIにおける心筋、および皮質プレート検出について検討した。
論文 参考訳(メタデータ) (2024-01-02T11:43:49Z) - SegRefiner: Towards Model-Agnostic Segmentation Refinement with Discrete
Diffusion Process [102.18226145874007]
そこで我々は,異なるセグメンテーションモデルによって生成されるオブジェクトマスクの品質を高めるために,SegRefinerと呼ばれるモデルに依存しないソリューションを提案する。
SegRefinerは粗いマスクを入力として取り、離散拡散プロセスを用いてそれらを洗練する。
さまざまな種類の粗いマスクにわたるセグメンテーションメトリックとバウンダリメトリックの両方を一貫して改善する。
論文 参考訳(メタデータ) (2023-12-19T18:53:47Z) - Morphologically-Aware Consensus Computation via Heuristics-based
IterATive Optimization (MACCHIatO) [1.8749305679160362]
本稿では,慎重に選択された距離のFr'echet平均に基づいて,二分法あるいは確率的コンセンサスセグメンテーションを構築する手法を提案する。
その結果,2値のコンセンサスマスクが多数投票とSTAPLEの中間サイズとなり,Mask Averaging法とSTAPLE法との違いが判明した。
論文 参考訳(メタデータ) (2023-09-14T23:28:58Z) - Denoising Diffusion Semantic Segmentation with Mask Prior Modeling [61.73352242029671]
本稿では,従来の識別的アプローチのセマンティックセグメンテーション品質を,デノナイズ拡散生成モデルでモデル化したマスクを用いて改善することを提案する。
市販セグメンタを用いた先行モデルの評価を行い,ADE20KとCityscapesの実験結果から,本手法が競争力のある定量的性能を実現することを示す。
論文 参考訳(メタデータ) (2023-06-02T17:47:01Z) - Self-Supervised Correction Learning for Semi-Supervised Biomedical Image
Segmentation [84.58210297703714]
半教師付きバイオメディカルイメージセグメンテーションのための自己教師付き補正学習パラダイムを提案する。
共有エンコーダと2つの独立デコーダを含むデュアルタスクネットワークを設計する。
異なるタスクのための3つの医用画像分割データセットの実験により,本手法の優れた性能が示された。
論文 参考訳(メタデータ) (2023-01-12T08:19:46Z) - PCA: Semi-supervised Segmentation with Patch Confidence Adversarial
Training [52.895952593202054]
医用画像セグメンテーションのためのPatch Confidence Adrial Training (PCA) と呼ばれる半教師付き対向法を提案する。
PCAは各パッチの画素構造とコンテキスト情報を学習し、十分な勾配フィードバックを得る。
本手法は, 医用画像のセグメンテーションにおいて, 最先端の半教師付き手法より優れており, その有効性を示している。
論文 参考訳(メタデータ) (2022-07-24T07:45:47Z) - Mixed-UNet: Refined Class Activation Mapping for Weakly-Supervised
Semantic Segmentation with Multi-scale Inference [28.409679398886304]
我々は、デコードフェーズに2つの並列分岐を持つMixed-UNetという新しいモデルを開発する。
地域病院や公開データセットから収集したデータセットに対して,いくつかの一般的なディープラーニングに基づくセグメンテーションアプローチに対して,設計したMixed-UNetを評価した。
論文 参考訳(メタデータ) (2022-05-06T08:37:02Z) - Synergy Between Semantic Segmentation and Image Denoising via Alternate
Boosting [102.19116213923614]
ノイズ除去とセグメンテーションを交互に行うためのブーストネットワークを提案する。
我々は,ノイズによるセグメンテーション精度の低下に対処するだけでなく,画素別意味情報によってデノージング能力が向上することを示す。
実験の結果,デノイド画像の品質が大幅に向上し,セグメンテーション精度がクリーン画像に近いことを示した。
論文 参考訳(メタデータ) (2021-02-24T06:48:45Z) - Towards Unsupervised Learning for Instrument Segmentation in Robotic
Surgery with Cycle-Consistent Adversarial Networks [54.00217496410142]
本稿では、入力された内視鏡画像と対応するアノテーションとのマッピングを学習することを目的として、未ペア画像から画像への変換を提案する。
当社のアプローチでは,高価なアノテーションを取得することなく,イメージセグメンテーションモデルをトレーニングすることが可能です。
提案手法をEndovis 2017チャレンジデータセットで検証し,教師付きセグメンテーション手法と競合することを示す。
論文 参考訳(メタデータ) (2020-07-09T01:39:39Z) - Weakly-Supervised Segmentation for Disease Localization in Chest X-Ray
Images [0.0]
医用胸部X線画像のセマンティックセグメンテーションに対する新しいアプローチを提案する。
本手法は肺と胸壁の間の異常な空気量を検出するための胸部X線検査に適用可能である。
論文 参考訳(メタデータ) (2020-07-01T20:48:35Z)
関連論文リストは本サイト内にある論文のタイトル・アブストラクトから自動的に作成しています。
指定された論文の情報です。
本サイトの運営者は本サイト(すべての情報・翻訳含む)の品質を保証せず、本サイト(すべての情報・翻訳含む)を使用して発生したあらゆる結果について一切の責任を負いません。