論文の概要: A Weakly Supervised Consistency-based Learning Method for COVID-19
Segmentation in CT Images
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2007.02180v2
- Date: Tue, 7 Jul 2020 11:56:15 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-11-13 13:57:33.723431
- Title: A Weakly Supervised Consistency-based Learning Method for COVID-19
Segmentation in CT Images
- Title(参考訳): ct画像におけるcovid-19セグメンテーションのための弱教師付き一貫性に基づく学習法
- Authors: Issam Laradji, Pau Rodriguez, Oscar Ma\~nas, Keegan Lensink, Marco
Law, Lironne Kurzman, William Parker, David Vazquez, and Derek Nowrouzezahrai
- Abstract要約: コロナウイルス病2019(COVID-19)は世界中で活発に広がり、現実的な健康危機を引き起こしている。
トモグラフィ(CT)画像中のCOVID-19を自動的に検出するシステムは、病気の重症度を定量化するのに役立つ。
我々は、CT画像上の各感染領域に1ピクセルのポイントアノテーションを要求することで、これらのラベル付けの課題に対処する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 11.778195406694206
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Coronavirus Disease 2019 (COVID-19) has spread aggressively across the world
causing an existential health crisis. Thus, having a system that automatically
detects COVID-19 in tomography (CT) images can assist in quantifying the
severity of the illness. Unfortunately, labelling chest CT scans requires
significant domain expertise, time, and effort. We address these labelling
challenges by only requiring point annotations, a single pixel for each
infected region on a CT image. This labeling scheme allows annotators to label
a pixel in a likely infected region, only taking 1-3 seconds, as opposed to
10-15 seconds to segment a region. Conventionally, segmentation models train on
point-level annotations using the cross-entropy loss function on these labels.
However, these models often suffer from low precision. Thus, we propose a
consistency-based (CB) loss function that encourages the output predictions to
be consistent with spatial transformations of the input images. The experiments
on 3 open-source COVID-19 datasets show that this loss function yields
significant improvement over conventional point-level loss functions and almost
matches the performance of models trained with full supervision with much less
human effort. Code is available at:
\url{https://github.com/IssamLaradji/covid19_weak_supervision}.
- Abstract(参考訳): コロナウイルス病2019(COVID-19)は世界中で活発に広がり、現実的な健康危機を引き起こしている。
したがって、トモグラフィ(CT)画像中のCOVID-19を自動的に検出するシステムを持つことで、病気の重症度を定量化することができる。
残念ながら、胸部CTのラベル付けには、かなりの専門知識、時間、努力が必要である。
我々は、CT画像上の各感染領域に1ピクセルのポイントアノテーションを要求することで、これらのラベル付け課題に対処する。
このラベル付け方式により、アノテータは感染する可能性のある領域のピクセルにラベルを付けることができ、領域を分割するのに10~15秒かかるのに対して、1~3秒しかかからない。
従来、セグメンテーションモデルはこれらのラベルのクロスエントロピー損失関数を使ってポイントレベルのアノテーションを訓練する。
しかし、これらのモデルはしばしば精度が低い。
そこで本稿では,出力予測を入力画像の空間変換に整合させるための整合性に基づく(CB)損失関数を提案する。
オープンソースの3つのCOVID-19データセットの実験によると、この損失関数は従来のポイントレベルの損失関数よりも大幅に改善され、完全な監視でトレーニングされたモデルのパフォーマンスとほぼ一致している。
コードは \url{https://github.com/issamlaradji/covid19_weak_supervision} で入手できる。
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