論文の概要: Anatomical Data Augmentation via Fluid-based Image Registration
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2007.02447v1
- Date: Sun, 5 Jul 2020 21:06:00 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-11-13 08:32:20.796111
- Title: Anatomical Data Augmentation via Fluid-based Image Registration
- Title(参考訳): 流体画像登録による解剖学的データ増大
- Authors: Zhengyang Shen, Zhenlin Xu, Sahin Olut, Marc Niethammer
- Abstract要約: 医用画像解析のための流体画像強調法を提案する。
既存の手法とは対照的に,我々のフレームワークは測地線部分空間を介して有意義な画像を生成する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 23.280420626023755
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: We introduce a fluid-based image augmentation method for medical image
analysis. In contrast to existing methods, our framework generates anatomically
meaningful images via interpolation from the geodesic subspace underlying given
samples. Our approach consists of three steps: 1) given a source image and a
set of target images, we construct a geodesic subspace using the Large
Deformation Diffeomorphic Metric Mapping (LDDMM) model; 2) we sample
transformations from the resulting geodesic subspace; 3) we obtain deformed
images and segmentations via interpolation. Experiments on brain (LPBA) and
knee (OAI) data illustrate the performance of our approach on two tasks: 1)
data augmentation during training and testing for image segmentation; 2)
one-shot learning for single atlas image segmentation. We demonstrate that our
approach generates anatomically meaningful data and improves performance on
these tasks over competing approaches. Code is available at
https://github.com/uncbiag/easyreg.
- Abstract(参考訳): 医用画像解析のための流体画像強調法を提案する。
既存の手法とは対照的に,本フレームワークは,与えられたサンプルの基盤となる測地線部分空間からの補間により,解剖学的に有意な画像を生成する。
私たちのアプローチは3つのステップからなる。
1) 原画像と対象画像の集合が与えられた場合、大変形拡散型距離マッピング(LDDMM)モデルを用いて測地部分空間を構築する。
2) 得られた測地線部分空間から変換をサンプリングする。
3)補間により変形画像とセグメンテーションを得る。
脳(LPBA)と膝(OAI)のデータを用いた実験では,2つの課題に対するアプローチのパフォーマンスが示されている。
1) 画像分割のための訓練及び試験中のデータ拡張
2)単一アトラス画像セグメンテーションのためのワンショット学習
我々は,本手法が解剖学的に意味のあるデータを生成し,これらのタスクの性能を競合するアプローチよりも向上することを示した。
コードはhttps://github.com/uncbiag/easyregで入手できる。
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