論文の概要: Mixture Representation Learning with Coupled Autoencoders
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2007.09880v3
- Date: Tue, 13 Apr 2021 02:02:27 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-11-08 12:36:41.368661
- Title: Mixture Representation Learning with Coupled Autoencoders
- Title(参考訳): 連成オートエンコーダを用いた混合表現学習
- Authors: Yeganeh M. Marghi, Rohan Gala, Uygar S\"umb\"ul
- Abstract要約: 我々は、cpl-mixVAEと呼ばれる複数の相互作用ネットワークを用いた教師なし変分フレームワークを提案する。
このフレームワークでは、各ネットワークの混合表現は、離散因子にコンセンサス制約を課すことで正規化される。
提案手法を用いて,単細胞転写データセットにおける遺伝子発現を記述した変数の離散的・連続的因子を共同で発見する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 1.589915930948668
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Jointly identifying a mixture of discrete and continuous factors of
variability without supervision is a key problem in unraveling complex
phenomena. Variational inference has emerged as a promising method to learn
interpretable mixture representations. However, posterior approximation in
high-dimensional latent spaces, particularly for discrete factors remains
challenging. Here, we propose an unsupervised variational framework using
multiple interacting networks called cpl-mixVAE that scales well to
high-dimensional discrete settings. In this framework, the mixture
representation of each network is regularized by imposing a consensus
constraint on the discrete factor. We justify the use of this framework by
providing both theoretical and experimental results. Finally, we use the
proposed method to jointly uncover discrete and continuous factors of
variability describing gene expression in a single-cell transcriptomic dataset
profiling more than a hundred cortical neuron types.
- Abstract(参考訳): 離散的要因と連続的要因の混合を監督なしで共同で同定することは、複雑な現象を解き放つ上で重要な問題である。
変分推論は解釈可能な混合表現を学ぶ有望な方法として現れた。
しかし、特に離散因子に対する高次元潜在空間の後方近似は依然として困難である。
本稿では,cpl-mixvaeと呼ばれる複数の相互作用ネットワークを用いた教師なし変分フレームワークを提案する。
このフレームワークでは、各ネットワークの混合表現は離散因子にコンセンサス制約を課すことで正規化される。
理論と実験の両方の結果を提供することで、このフレームワークの使用を正当化する。
最後に,100種類以上の大脳皮質ニューロンをプロファイリングした単細胞転写データセットにおいて,遺伝子発現を記述した変異因子と連続因子を共同で同定する手法を提案する。
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