論文の概要: COVID TV-UNet: Segmenting COVID-19 Chest CT Images Using Connectivity
Imposed U-Net
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2007.12303v3
- Date: Thu, 6 Aug 2020 22:59:04 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-11-07 06:31:24.525911
- Title: COVID TV-UNet: Segmenting COVID-19 Chest CT Images Using Connectivity
Imposed U-Net
- Title(参考訳): ネット接続を利用したcovid-19胸部ct画像のセグメンテーション
- Authors: Narges Saeedizadeh, Shervin Minaee, Rahele Kafieh, Shakib Yazdani,
Milan Sonka
- Abstract要約: コロナウイルス(COVID-19)は世界中で200カ国以上で大流行している。
CT画像はRT-PCR検査の代替として使用できる。
新型コロナウイルスに感染したCT画像の胸部領域を検出するためのセグメンテーションフレームワークを提案する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 5.174558376705871
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: The novel corona-virus disease (COVID-19) pandemic has caused a major
outbreak in more than 200 countries around the world, leading to a severe
impact on the health and life of many people globally. As of mid-July 2020,
more than 12 million people were infected, and more than 570,000 death were
reported. Computed Tomography (CT) images can be used as an alternative to the
time-consuming RT-PCR test, to detect COVID-19. In this work we propose a
segmentation framework to detect chest regions in CT images, which are infected
by COVID-19. We use an architecture similar to U-Net model, and train it to
detect ground glass regions, on pixel level. As the infected regions tend to
form a connected component (rather than randomly distributed pixels), we add a
suitable regularization term to the loss function, to promote connectivity of
the segmentation map for COVID-19 pixels. 2D-anisotropic total-variation is
used for this purpose, and therefore the proposed model is called "TV-UNet".
Through experimental results on a relatively large-scale CT segmentation
dataset of around 900 images, we show that adding this new regularization term
leads to 2\% gain on overall segmentation performance compared to the U-Net
model. Our experimental analysis, ranging from visual evaluation of the
predicted segmentation results to quantitative assessment of segmentation
performance (precision, recall, Dice score, and mIoU) demonstrated great
ability to identify COVID-19 associated regions of the lungs, achieving a mIoU
rate of over 99\%, and a Dice score of around 86\%.
- Abstract(参考訳): 新型コロナウイルス(COVID-19)のパンデミックが世界中で200カ国以上で大流行し、世界中の多くの人々の健康と生活に深刻な影響を与えている。
2020年7月中旬時点で、1200万人以上が感染し、570万人以上が死亡した。
CT画像は、時間を要するRT-PCR検査の代替として、COVID-19を検出するために使用できる。
本研究では, 新型コロナウイルスに感染したCT画像の胸部領域を検出するためのセグメンテーションフレームワークを提案する。
我々は,U-Netモデルに似たアーキテクチャを用いて,地上ガラス領域をピクセルレベルで検出するように訓練する。
感染領域は(ランダムに分散したピクセルではなく)連結成分を形成する傾向があるため、ロス関数に適切な正規化項を加え、COVID-19ピクセルのセグメンテーションマップの接続を促進する。
2d-異方性全変量はこの目的のために用いられており、提案モデルは「tv-unet」と呼ばれる。
約900画像の比較的大規模なctセグメンテーションデータセットにおける実験の結果から,この新たな正規化項を付加すると,u-netモデルと比較して全体のセグメンテーション性能が2-%向上することが示された。
予測した分節化結果の視覚的評価から分節化性能の定量的評価(precision, recall, dice score, miou)まで,肺のcovid-19関連領域の同定,miou率99\%,diceスコア約86\%の達成に至らしめた。
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