論文の概要: CorrSigNet: Learning CORRelated Prostate Cancer SIGnatures from
Radiology and Pathology Images for Improved Computer Aided Diagnosis
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2008.00119v1
- Date: Fri, 31 Jul 2020 23:44:25 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-11-04 07:16:43.975325
- Title: CorrSigNet: Learning CORRelated Prostate Cancer SIGnatures from
Radiology and Pathology Images for Improved Computer Aided Diagnosis
- Title(参考訳): CorrSigNet: 放射線画像と病理画像からCRRELated Prostate Cancer SIGnaturesを学習してコンピュータ支援診断を改善する
- Authors: Indrani Bhattacharya and Arun Seetharaman and Wei Shao and Rewa Sood
and Christian A. Kunder and Richard E. Fan and Simon John Christoph Soerensen
and Jeffrey B. Wang and Pejman Ghanouni and Nikola C. Teslovich and James D.
Brooks and Geoffrey A. Sonn and Mirabela Rusu
- Abstract要約: 我々はMRIで前立腺癌を局所化する2段階自動モデルであるCorrSigNetを提案する。
まず,病理組織学的特徴と相関するがんのMRI所見を学習する。
第二に、このモデルは、学習した相関MRI機能を使用して、前立腺がんの局所化のために畳み込みニューラルネットワークを訓練する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 1.63324350193061
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Magnetic Resonance Imaging (MRI) is widely used for screening and staging
prostate cancer. However, many prostate cancers have subtle features which are
not easily identifiable on MRI, resulting in missed diagnoses and alarming
variability in radiologist interpretation. Machine learning models have been
developed in an effort to improve cancer identification, but current models
localize cancer using MRI-derived features, while failing to consider the
disease pathology characteristics observed on resected tissue. In this paper,
we propose CorrSigNet, an automated two-step model that localizes prostate
cancer on MRI by capturing the pathology features of cancer. First, the model
learns MRI signatures of cancer that are correlated with corresponding
histopathology features using Common Representation Learning. Second, the model
uses the learned correlated MRI features to train a Convolutional Neural
Network to localize prostate cancer. The histopathology images are used only in
the first step to learn the correlated features. Once learned, these correlated
features can be extracted from MRI of new patients (without histopathology or
surgery) to localize cancer. We trained and validated our framework on a unique
dataset of 75 patients with 806 slices who underwent MRI followed by
prostatectomy surgery. We tested our method on an independent test set of 20
prostatectomy patients (139 slices, 24 cancerous lesions, 1.12M pixels) and
achieved a per-pixel sensitivity of 0.81, specificity of 0.71, AUC of 0.86 and
a per-lesion AUC of $0.96 \pm 0.07$, outperforming the current state-of-the-art
accuracy in predicting prostate cancer using MRI.
- Abstract(参考訳): MRIは前立腺がんのスクリーニングやステージングに広く用いられている。
しかし、多くの前立腺癌はMRIでは容易に識別できない微妙な特徴を有しており、診断に失敗し、放射線学の解釈に異常が生じる。
機械学習モデルは、がんの同定を改善するために開発されたが、現在のモデルは、MRIによる特徴を用いてがんを局在させるが、切除組織で観察される疾患の病態の特徴を考慮しない。
本稿では,MRIで前立腺癌を局所化する2段階自動モデルであるCorrSigNetを提案する。
まず, 共通表現学習を用いて, 対応する病理組織学的特徴に関連付けられたがんのmri所見を学習する。
第二に、学習した相関MRI機能を使って、畳み込みニューラルネットワークをトレーニングし、前立腺がんを局所化する。
病理組織像は、相関する特徴を学習するために第1段階のみ使用される。
これらの特徴は、(病理組織学や手術なしで)新しい患者のmriから抽出され、がんを局在化することができる。
前立腺切除術を施行した806スライス75例を対象に,本フレームワークを訓練,検証した。
前立腺癌症例20例(139例,24例,112万画素)の独立した検査群を用いて,1画素あたりの感度0.81,特異度0.71,auc 0.86,1レシオンauc$0.96 \pm 0.07$を,mriを用いた前立腺癌予測における現在の精度を上回った。
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