論文の概要: From Human Mesenchymal Stromal Cells to Osteosarcoma Cells
Classification by Deep Learning
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2008.01864v1
- Date: Tue, 4 Aug 2020 22:23:58 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-11-03 00:50:54.557881
- Title: From Human Mesenchymal Stromal Cells to Osteosarcoma Cells
Classification by Deep Learning
- Title(参考訳): 深層学習によるヒト間葉系幹細胞から骨肉腫細胞分類へ
- Authors: Mario D'Acunto, Massimo Martinelli, Davide Moroni
- Abstract要約: 骨肉腫は, 青年期における悪性骨腫瘍の1つである。
骨肉腫細胞とヒト間葉系間葉系間葉系間葉系間葉系細胞(MSC)を鑑別し,検討中の細胞集団を分類するためにDLアプローチを適用した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.18143184797612422
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Early diagnosis of cancer often allows for a more vast choice of therapy
opportunities. After a cancer diagnosis, staging provides essential information
about the extent of disease in the body and the expected response to a
particular treatment. The leading importance of classifying cancer patients at
the early stage into high or low-risk groups has led many research teams, both
from the biomedical and bioinformatics field, to study the application of Deep
Learning (DL) methods. The ability of DL to detect critical features from
complex datasets is a significant achievement in early diagnosis and cell
cancer progression. In this paper, we focus the attention on osteosarcoma.
Osteosarcoma is one of the primary malignant bone tumors which usually afflicts
people in adolescence. Our contribution to the classification of osteosarcoma
cells is made as follows: a DL approach is applied to discriminate human
Mesenchymal Stromal Cells (MSCs) from osteosarcoma cells and to classify the
different cell populations under investigation. Glass slides of differ-ent cell
populations were cultured including MSCs, differentiated in healthy bone cells
(osteoblasts) and osteosarcoma cells, both single cell populations or mixed.
Images of such samples of isolated cells (single-type of mixed) are recorded
with traditional optical microscopy. DL is then applied to identify and
classify single cells. Proper data augmentation techniques and cross-fold
validation are used to appreciate the capabilities of a convolutional neural
network to address the cell detection and classification problem. Based on the
results obtained on individual cells, and to the versatility and scalability of
our DL approach, the next step will be its application to discriminate and
classify healthy or cancer tissues to advance digital pathology.
- Abstract(参考訳): 早期がんの診断は、しばしば治療の機会をより広く選択することができる。
がん診断の後、ステージングは体内の疾患の程度と特定の治療に対する期待された反応に関する重要な情報を提供する。
早期のがん患者を高リスクまたは低リスクグループに分類することの重要性は, バイオメディカルおよびバイオインフォマティクスの分野から, 深層学習(DL)法の応用研究まで, 多くの研究チームを導いている。
複雑なデータセットから重要な特徴を検出するDLの能力は、早期診断と細胞癌の進行において重要な成果である。
本稿では骨肉腫に焦点をあてる。
骨肉腫は原発性悪性骨腫瘍の1つで、通常は青年期に苦しむ。
ヒト間葉系間質細胞(mscs)を骨肉腫細胞から識別し,調査中の異なる細胞集団を分類するためにdlアプローチを適用した。
健全な骨細胞(骨芽細胞)と骨肉腫細胞(単細胞または混合細胞)で分化したmscを含む異種細胞集団のガラススライドを培養した。
このような単離された細胞の画像(単一型混合)は、伝統的な光学顕微鏡で記録される。
DLは単一細胞の同定と分類に使用される。
細胞検出と分類問題に対処する畳み込みニューラルネットワークの能力を評価するために、適切なデータ拡張技術とクロスフォールド検証が使用される。
個々の細胞で得られた結果と、我々のDLアプローチの汎用性とスケーラビリティに基づいて、次のステップは、健康組織やがん組織を識別・分類し、デジタル病理を進歩させるための応用である。
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