論文の概要: Image Segmentation of Zona-Ablated Human Blastocysts
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2008.08673v1
- Date: Wed, 19 Aug 2020 21:20:02 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-10-27 11:43:55.762642
- Title: Image Segmentation of Zona-Ablated Human Blastocysts
- Title(参考訳): zonaによるヒト胚盤胞の画像分割
- Authors: Md Yousuf Harun, M Arifur Rahman, Joshua Mellinger, Willy Chang,
Thomas Huang, Brienne Walker, Kristen Hori, and Aaron T. Ohta
- Abstract要約: この研究の目的は、不規則な形をした胚盤胞を分断する難しい作業を促進することである。
実験結果から, セグメンテーションは拡張測定の精度を大幅に向上させることが示された。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Automating human preimplantation embryo grading offers the potential for
higher success rates with in vitro fertilization (IVF) by providing new
quantitative and objective measures of embryo quality. Current IVF procedures
typically use only qualitative manual grading, which is limited in the
identification of genetically abnormal embryos. The automatic quantitative
assessment of blastocyst expansion can potentially improve sustained pregnancy
rates and reduce health risks from abnormal pregnancies through a more accurate
identification of genetic abnormality. The expansion rate of a blastocyst is an
important morphological feature to determine the quality of a developing
embryo. In this work, a deep learning based human blastocyst image segmentation
method is presented, with the goal of facilitating the challenging task of
segmenting irregularly shaped blastocysts. The type of blastocysts evaluated
here has undergone laser ablation of the zona pellucida, which is required
prior to trophectoderm biopsy. This complicates the manual measurements of the
expanded blastocyst's size, which shows a correlation with genetic
abnormalities. The experimental results on the test set demonstrate
segmentation greatly improves the accuracy of expansion measurements, resulting
in up to 99.4% accuracy, 98.1% precision, 98.8% recall, a 98.4% Dice
Coefficient, and a 96.9% Jaccard Index.
- Abstract(参考訳): ヒト胚移植の自動化は、新しい定量的かつ客観的な胚品質測定を提供することにより、体外受精(IVF)による高い成功率をもたらす可能性がある。
現在のIVFプロシージャは、通常、定性的手動グレーディングのみを使用し、遺伝的に異常な胚の同定に制限される。
胚盤胞拡張の自動定量評価は、持続妊娠率を向上し、遺伝的異常のより正確な同定によって異常妊娠からの健康リスクを低減する可能性がある。
胚盤胞の増殖速度は発育する胚の質を決定する重要な形態学的特徴である。
本研究は,不規則な形状の胚盤胞を分割することの難易度を高めることを目的として,深層学習に基づくヒト胚盤胞画像分割法を提案する。
ここで評価される胚盤嚢胞の種類は、眼窩生検の前に必要となる帯状骨化症をレーザーアブレーションしたものである。
これは伸長した胚盤胞の大きさの手動測定を複雑にし、遺伝的異常との相関を示す。
実験の結果、セグメンテーションは拡張測定の精度を大幅に向上させ、99.4%の精度、98.1%の精度、98.8%のリコール、98.4%のサイコロ係数、96.9%のjaccard指数が得られた。
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