論文の概要: A persistent homology-based topological loss function for multi-class
CNN segmentation of cardiac MRI
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2008.09585v1
- Date: Fri, 21 Aug 2020 17:09:13 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-10-26 22:12:05.919433
- Title: A persistent homology-based topological loss function for multi-class
CNN segmentation of cardiac MRI
- Title(参考訳): 心筋MRIのマルチクラスCNNセグメンテーションにおける持続的ホモロジーに基づく位相損失関数
- Authors: Nick Byrne, James R. Clough, Giovanni Montana, Andrew P. King
- Abstract要約: 可能なラベルとラベルペアをすべて考慮し,より豊かなセグメンテーショントポロジの記述を構築する。
これらのトポロジカル事前は、ACDC短軸CMRトレーニングデータセットから150個のサンプルのサブセットで全てのトポロジカルエラーを解決することができる。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 7.993897173085253
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: With respect to spatial overlap, CNN-based segmentation of short axis
cardiovascular magnetic resonance (CMR) images has achieved a level of
performance consistent with inter observer variation. However, conventional
training procedures frequently depend on pixel-wise loss functions, limiting
optimisation with respect to extended or global features. As a result, inferred
segmentations can lack spatial coherence, including spurious connected
components or holes. Such results are implausible, violating the anticipated
topology of image segments, which is frequently known a priori. Addressing this
challenge, published work has employed persistent homology, constructing
topological loss functions for the evaluation of image segments against an
explicit prior. Building a richer description of segmentation topology by
considering all possible labels and label pairs, we extend these losses to the
task of multi-class segmentation. These topological priors allow us to resolve
all topological errors in a subset of 150 examples from the ACDC short axis CMR
training data set, without sacrificing overlap performance.
- Abstract(参考訳): 空間的重なりについては,CNNによる短軸心血管磁気共鳴(CMR)画像のセグメンテーションは,観察者間変動と同等の性能を示した。
しかし、従来の訓練手順は画素単位の損失関数に依存し、拡張やグローバルな特徴に対する最適化を制限する。
その結果、推定されたセグメンテーションは、突発的な連結成分や穴を含む空間的コヒーレンスを欠くことができる。
このような結果は、しばしば優先順位として知られる画像セグメントの予測されたトポロジーに違反し、目立たない。
この課題に対処するために、公開された研究は、画像セグメントを明示的な事前評価のために位相的損失関数を構築した永続的ホモロジーを用いている。
すべての可能なラベルとラベルペアを考慮し、より豊かなセグメンテーショントポロジの記述を構築することで、これらの損失をマルチクラスセグメンテーションのタスクに拡張する。
これらのトポロジカル事前は、オーバーラップ性能を犠牲にすることなく、ACDC短軸CMRトレーニングデータセットから150の例のサブセットで全てのトポロジカルエラーを解決することができる。
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