論文の概要: PI-Att: Topology Attention for Segmentation Networks through Adaptive Persistence Image Representation
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2408.08038v1
- Date: Thu, 15 Aug 2024 09:06:49 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2024-08-16 14:26:13.348973
- Title: PI-Att: Topology Attention for Segmentation Networks through Adaptive Persistence Image Representation
- Title(参考訳): PI-Att:適応パーシステンス画像表現によるセグメンテーションネットワークのトポロジーアテンション
- Authors: Mehmet Bahadir Erden, Sinan Unver, Ilke Ali Gurses, Rustu Turkay, Cigdem Gunduz-Demir,
- Abstract要約: 我々は,新たなトポロジ認識損失関数を導入し,ネットワークに対して,地上の真実と予測マップのトポロジ的相違を最小化するよう強制する。
セグメント化ネットワーク損失の文脈において,各マップのトポロジを永続画像表現によって定量化する。
提案したPI-Att損失は, 大動脈と大血管のセグメンテーションの2つの異なるデータセットで評価された。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 1.4680035572775534
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Segmenting multiple objects (e.g., organs) in medical images often requires an understanding of their topology, which simultaneously quantifies the shape of the objects and their positions relative to each other. This understanding is important for segmentation networks to generalize better with limited training data, which is common in medical image analysis. However, many popular networks were trained to optimize only pixel-wise performance, ignoring the topological correctness of the segmentation. In this paper, we introduce a new topology-aware loss function, which we call PI-Att, that explicitly forces the network to minimize the topological dissimilarity between the ground truth and prediction maps. We quantify the topology of each map by the persistence image representation, for the first time in the context of a segmentation network loss. Besides, we propose a new mechanism to adaptively calculate the persistence image at the end of each epoch based on the network's performance. This adaptive calculation enables the network to learn topology outline in the first epochs, and then topology details towards the end of training. The effectiveness of the proposed PI-Att loss is demonstrated on two different datasets for aorta and great vessel segmentation in computed tomography images.
- Abstract(参考訳): 医療画像中の複数の物体(例えば臓器)を分割するには、しばしばそのトポロジーを理解する必要がある。
この理解は、医療画像解析に共通する限られたトレーニングデータにより、セグメンテーションネットワークをより一般化する上で重要である。
しかし、多くの人気ネットワークは、セグメンテーションのトポロジカルな正確さを無視して、ピクセルワイドのパフォーマンスのみを最適化するように訓練された。
本稿では,PI-Attと呼ばれる新たなトポロジ認識損失関数を提案する。
セグメント化ネットワーク損失の文脈において,各マップのトポロジを永続画像表現によって定量化する。
さらに,ネットワークの性能に基づいて,各エポックの終端における永続画像を適応的に算出する機構を提案する。
この適応計算により、ネットワークは最初のエポックでトポロジーのアウトラインを学習し、その後、トレーニングの終了に向けてトポロジーの詳細を学習することができる。
提案したPI-Att損失は, 大動脈と大血管のセグメンテーションの2つの異なるデータセットで評価された。
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