論文の概要: Non-parametric generalized linear model
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2009.01362v1
- Date: Wed, 2 Sep 2020 21:54:53 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-10-22 18:44:22.434668
- Title: Non-parametric generalized linear model
- Title(参考訳): 非パラメトリック一般化線形モデル
- Authors: Matthew Dowling, Yuan Zhao, Il Memming Park
- Abstract要約: 統計神経科学の基本的な問題は、ニューロンが電気生理学的記録を分析して情報をエンコードする方法をモデル化することである。
人気があり広く使われているアプローチは、スパイク列車を自動回帰ポイントプロセスモデルに適合させることである。
実際には、フィルターをパラメータ化するためには、十分にリッチだが小さな時間基底関数のアンサンブルを選択する必要がある。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 7.936841911281107
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: A fundamental problem in statistical neuroscience is to model how neurons
encode information by analyzing electrophysiological recordings. A popular and
widely-used approach is to fit the spike trains with an autoregressive point
process model. These models are characterized by a set of convolutional
temporal filters, whose subsequent analysis can help reveal how neurons encode
stimuli, interact with each other, and process information. In practice a
sufficiently rich but small ensemble of temporal basis functions needs to be
chosen to parameterize the filters. However, obtaining a satisfactory fit often
requires burdensome model selection and fine tuning the form of the basis
functions and their temporal span. In this paper we propose a nonparametric
approach for jointly inferring the filters and hyperparameters using the
Gaussian process framework. Our method is computationally efficient taking
advantage of the sparse variational approximation while being flexible and rich
enough to characterize arbitrary filters in continuous time lag. Moreover, our
method automatically learns the temporal span of the filter. For the particular
application in neuroscience, we designed priors for stimulus and history
filters useful for the spike trains. We compare and validate our method on
simulated and real neural spike train data.
- Abstract(参考訳): 統計神経科学の基本的な問題は、ニューロンが電気生理学的記録を分析して情報をエンコードする方法をモデル化することである。
広く使われているアプローチは、スパイク列車を自動回帰ポイントプロセスモデルに適合させることである。
これらのモデルは、神経細胞が刺激をコードし、相互に相互作用し、情報を処理する方法を明らかにするのに役立つ一連の畳み込み時間フィルタによって特徴づけられる。
実際には、フィルタをパラメータ化するために十分なリッチだが小さな時間基底関数のアンサンブルを選択する必要がある。
しかし、満足のいく適合を得るには、しばしば重荷のかかるモデル選択と基底関数の形式とその時間的スパンの微調整が必要となる。
本稿では,ガウス過程フレームワークを用いてフィルタとハイパーパラメータを共同で推定する非パラメトリック手法を提案する。
連続時間ラグで任意のフィルタを特徴付けるのに十分な柔軟性と豊かさを保ちながら,スパース変分近似の利点を生かし,計算的に効率的である。
さらに,フィルタの時間的スパンを自動的に学習する。
神経科学の特定の応用として、スパイク列車に有用な刺激や履歴フィルタの事前設計を行った。
シミュレーションデータと実際のスパイクトレインデータの比較検証を行った。
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