論文の概要: Large-scale nonlinear Granger causality: A data-driven, multivariate
approach to recovering directed networks from short time-series data
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2009.04681v1
- Date: Thu, 10 Sep 2020 06:27:57 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-10-20 03:12:29.535100
- Title: Large-scale nonlinear Granger causality: A data-driven, multivariate
approach to recovering directed networks from short time-series data
- Title(参考訳): 大規模非線形グランジャー因果関係:短時系列データから有向ネットワークを復元するデータ駆動多変量アプローチ
- Authors: Axel Wism\"uller, Adora M. DSouza and Anas Z. Abidin
- Abstract要約: 本稿では,システムコンポーネント間の因果関係を推定するための大規模Granger Causality (lsNGC) アプローチを提案する。
lsNGCは、コンポーネント時系列間の機能的相互依存性に関する明示的な事前仮定を持たないカジュアルな関係を識別する。
我々は,2ノードから34ノードのカオス時系列システムにおいて,ネットワーク構造を復元するlsNGCの能力について検討した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: To gain insight into complex systems it is a key challenge to infer nonlinear
causal directional relations from observational time-series data. Specifically,
estimating causal relationships between interacting components in large systems
with only short recordings over few temporal observations remains an important,
yet unresolved problem. Here, we introduce a large-scale Nonlinear Granger
Causality (lsNGC) approach for inferring directional, nonlinear, multivariate
causal interactions between system components from short high-dimensional
time-series recordings. By modeling interactions with nonlinear state-space
transformations from limited observational data, lsNGC identifies casual
relations with no explicit a priori assumptions on functional interdependence
between component time-series in a computationally efficient manner.
Additionally, our method provides a mathematical formulation revealing
statistical significance of inferred causal relations. We extensively study the
ability of lsNGC to recovering network structure from two-node to thirty-four
node chaotic time-series systems. Our results suggest that lsNGC captures
meaningful interactions from limited observational data, where it performs
favorably when compared to traditionally used methods. Finally, we demonstrate
the applicability of lsNGC to estimating causality in large, real-world systems
by inferring directional nonlinear, multivariate causal relationships among a
large number of relatively short time-series acquired from functional Magnetic
Resonance Imaging (fMRI) data of the human brain.
- Abstract(参考訳): 複雑なシステムに対する洞察を得るためには,観測時系列データから非線形因果関係を推定することが重要である。
特に、わずかな時間的観測で短い記録しか持たない大規模システムにおける相互作用成分間の因果関係を推定することは、重要だが未解決の問題である。
本稿では,高次元時系列記録からシステムコンポーネント間の方向性,非線形,多変量因果関係を推定するための大規模非線形グランガー因果関係(LSNGC)手法を提案する。
限られた観測データからの非線形状態空間変換との相互作用をモデル化することにより、lsNGCは計算的に効率的な構成時間列間の関数的相互依存性に関する明示的な前提のないカジュアルな関係を同定する。
さらに,推論因果関係の統計的意義を明らかにする数学的定式化も提供する。
我々は,2ノードから34ノードのカオス時系列システムにおいて,ネットワーク構造を復元するlsNGCの能力について検討した。
以上の結果から,lsNGCは観測データから有意義な相互作用を捉え,従来の手法に比べて良好に機能することが示唆された。
最後に, 機能的磁気共鳴画像(fMRI)データから得られた比較的短い時間系列のうち, 指向性非線形多変量因果関係を推定することにより, 大規模実世界のシステムにおける因果関係推定へのlsNGCの適用性を実証した。
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