論文の概要: nnU-Net for Brain Tumor Segmentation
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2011.00848v1
- Date: Mon, 2 Nov 2020 09:44:27 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-09-30 12:51:23.002041
- Title: nnU-Net for Brain Tumor Segmentation
- Title(参考訳): 脳腫瘍分離のためのnnU-Net
- Authors: Fabian Isensee, Paul F. Jaeger, Peter M. Full, Philipp Vollmuth, Klaus
H. Maier-Hein
- Abstract要約: 我々はBraTS 2020チャレンジのセグメンテーションタスクにnnU-Netを適用した。
後処理、地域ベースのトレーニング、より積極的なデータ拡張、およびnnU-Netパイプラインへのいくつかのマイナーな変更について、BraTS固有の修正を取り入れています。
最終アンサンブルはBraTS 2020で,Diceスコア88.95,85.06,82.03,HD95値8.498,17.337,17.805,腫瘍コア17.805で初優勝した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 2.570461548729326
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: We apply nnU-Net to the segmentation task of the BraTS 2020 challenge. The
unmodified nnU-Net baseline configuration already achieves a respectable
result. By incorporating BraTS-specific modifications regarding postprocessing,
region-based training, a more aggressive data augmentation as well as several
minor modifications to the nnUNet pipeline we are able to improve its
segmentation performance substantially. We furthermore re-implement the BraTS
ranking scheme to determine which of our nnU-Net variants best fits the
requirements imposed by it. Our final ensemble took the first place in the
BraTS 2020 competition with Dice scores of 88.95, 85.06 and 82.03 and HD95
values of 8.498,17.337 and 17.805 for whole tumor, tumor core and enhancing
tumor, respectively.
- Abstract(参考訳): 我々はBraTS 2020チャレンジのセグメンテーションタスクにnnU-Netを適用する。
未修正のnnU-Netベースライン構成は、すでに見事な結果が得られる。
ポストプロセッシング、リージョンベーストレーニング、より積極的なデータ拡張、nnunetパイプラインのマイナーな変更に関するbrats固有の変更を組み込むことで、セグメント化性能を大幅に改善することができる。
さらに、我々のnU-Net変種のうちどれが最も適しているかを決定するために、BraTSランキングスキームを再実装する。
ブラッツ2020では88.95,85.06,82.03点,hd958.498,17.337点,17.805点のdiceスコアがそれぞれ,腫瘍,腫瘍コア,造影腫瘍のそれぞれにおいて第1位となった。
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