論文の概要: Recursive Deep Prior Video: a Super Resolution algorithm for Time-Lapse
Microscopy of organ-on-chip experiments
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2011.09855v1
- Date: Thu, 19 Nov 2020 14:36:33 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-09-23 21:45:14.663760
- Title: Recursive Deep Prior Video: a Super Resolution algorithm for Time-Lapse
Microscopy of organ-on-chip experiments
- Title(参考訳): 再帰的ディーププリアービデオ:臓器オンチップ実験の時間経過顕微鏡のための超解像アルゴリズム
- Authors: Pasquale Cascarano, Maria Colomba Comes, Arianna Mencattini, Maria
Carla Parrini, Elena Loli Piccolomini, Eugenio Martinelli
- Abstract要約: 我々は、よく知られたDeep Image Prior(DIP)を、トレーニングを必要とせずにTLM Video Super Resolution(SR)に拡張する、新しいディープラーニングベースのアルゴリズムを提案する。
結果は、最先端の訓練されたディープラーニングSRアルゴリズムと比較され、優れた性能を示している。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Biological experiments based on organ-on-chips (OOCs) exploit light
Time-Lapse Microscopy (TLM) for a direct observation of cell movement that is
an observable signature of underlying biological processes. A high spatial
resolution is essential to capture cell dynamics and interactions from recorded
experiments by TLM. Unfortunately, due to physical and cost limitations,
acquiring high resolution videos is not always possible. To overcome the
problem, we present here a new deep learning-based algorithm that extends the
well known Deep Image Prior (DIP) to TLM Video Super Resolution (SR) without
requiring any training. The proposed Recursive Deep Prior Video (RDPV) method
introduces some novelties. The weights of the DIP network architecture are
initialized for each of the frames according to a new recursive updating rule
combined with an efficient early stopping criterion. Moreover, the DIP loss
function is penalized by two different Total Variation (TV) based terms. The
method has been validated on synthetic, i.e., artificially generated, as well
as real videos from OOC experiments related to tumor-immune interaction.
Achieved results are compared with several state-of-the-art trained deep
learning SR algorithms showing outstanding performances.
- Abstract(参考訳): organ-on-chips (oocs) に基づく生物実験では、光時間経過顕微鏡 (tlm) を用いて、基礎となる生物学的過程の観察可能なシグネチャである細胞の動きを直接観察する。
高い空間分解能は、TLMによる記録実験から細胞動態と相互作用を捉えるのに不可欠である。
残念ながら、物理的およびコストの制限のため、高解像度ビデオの取得は必ずしも不可能ではない。
そこで本研究では,よく知られたDeep Image Prior(DIP)を,トレーニングを必要とせずにTLM Video Super Resolution(SR)に拡張する,ディープラーニングに基づく新しいアルゴリズムを提案する。
RDPV(Recursive Deep Prior Video)法では,新しい手法が提案されている。
DIPネットワークアーキテクチャの重みは、新しい再帰的更新ルールと効率的な早期停止基準とを組み合わせて、フレーム毎に初期化される。
さらに、DIP損失関数は2つの異なるトータル変分(TV)に基づいてペナル化される。
この方法は、合成、すなわち人工生成、および腫瘍と免疫の相互作用に関連するooc実験の実際のビデオで検証されている。
達成された結果は、最先端のトレーニングされたディープラーニングsrアルゴリズムと比較される。
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