論文の概要: Predicting Patient COVID-19 Disease Severity by means of Statistical and
Machine Learning Analysis of Blood Cell Transcriptome Data
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2011.10657v1
- Date: Thu, 19 Nov 2020 10:32:46 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-09-23 22:02:05.386468
- Title: Predicting Patient COVID-19 Disease Severity by means of Statistical and
Machine Learning Analysis of Blood Cell Transcriptome Data
- Title(参考訳): 血液細胞トランスクリプトームデータの統計的および機械学習による患者の新型コロナウイルス重症度予測
- Authors: Sakifa Aktar, Md. Martuza Ahamad, Md. Rashed-Al-Mahfuz, AKM Azad,
Shahadat Uddin, A H M Kamal, Salem A. Alyami, Ping-I Lin, Sheikh Mohammed
Shariful Islam, Julian M.W. Quinn, Valsamma Eapen, and Mohammad Ali Moni
- Abstract要約: 患者末梢血のデータを用いて臨床結果を予測する方法について検討した。
本研究は, 健常人と陽性患者とを鑑別し, 血液検査で測定可能な臨床パラメータをいくつか明らかにした。
そこで我々は,90%以上の重症度と死亡率予測の精度と精度を示す分析手法を多数開発した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 3.5699804146136676
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Introduction: For COVID-19 patients accurate prediction of disease severity
and mortality risk would greatly improve care delivery and resource allocation.
There are many patient-related factors, such as pre-existing comorbidities that
affect disease severity. Since rapid automated profiling of peripheral blood
samples is widely available, we investigated how such data from the peripheral
blood of COVID-19 patients might be used to predict clinical outcomes.
Methods: We thus investigated such clinical datasets from COVID-19 patients
with known outcomes by combining statistical comparison and correlation methods
with machine learning algorithms; the latter included decision tree, random
forest, variants of gradient boosting machine, support vector machine,
K-nearest neighbour and deep learning methods.
Results: Our work revealed several clinical parameters measurable in blood
samples, which discriminated between healthy people and COVID-19 positive
patients and showed predictive value for later severity of COVID-19 symptoms.
We thus developed a number of analytic methods that showed accuracy and
precision for disease severity and mortality outcome predictions that were
above 90%.
Conclusions: In sum, we developed methodologies to analyse patient routine
clinical data which enables more accurate prediction of COVID-19 patient
outcomes. This type of approaches could, by employing standard hospital
laboratory analyses of patient blood, be utilised to identify, COVID-19
patients at high risk of mortality and so enable their treatment to be
optimised.
- Abstract(参考訳): 導入:新型コロナウイルス患者の重症度と死亡リスクの正確な予測は、ケアデリバリーとリソース割り当てを大幅に改善する。
疾患の重症度に影響を及ぼす既往の相乗効果など、多くの患者関連要因がある。
末梢血サンプルの迅速自動分析が広く利用可能であることから, 臨床予後予測に新型コロナウイルス患者の末梢血データがどのように用いられるか検討した。
方法: 統計的比較法と相関法を機械学習アルゴリズムと組み合わせることで, 新型コロナウイルス患者から得られた臨床データセットを調査した。後者は, 決定木, ランダムフォレスト, 勾配ブースティングマシンの変種, サポートベクターマシン, k-nearest近傍, 深層学習法である。
結果: 血液検査で測定可能ないくつかの臨床指標が, 健常者と新型コロナウイルス陽性者の間で判別され, その後の重症化の予測値を示した。
そこで我々は,90%以上の重症度と死亡率予測の精度と精度を示す分析手法を多数開発した。
結論: 患者の日常的な臨床データを分析し, より正確な患者結果の予測を可能にする手法を開発した。
この種のアプローチは、患者の血液の標準的な病院検査結果を用いて、死亡リスクの高いcovid-19患者を特定できるため、治療を最適化することができる。
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