論文の概要: Using Radiomics as Prior Knowledge for Thorax Disease Classification and
Localization in Chest X-rays
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2011.12506v3
- Date: Fri, 9 Jul 2021 20:29:44 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-09-21 02:55:42.136729
- Title: Using Radiomics as Prior Knowledge for Thorax Disease Classification and
Localization in Chest X-rays
- Title(参考訳): 胸部X線における胸部疾患の分類と局在の事前知識としての放射線学
- Authors: Yan Han, Chongyan Chen, Liyan Tang, Mingquan Lin, Ajay Jaiswal, Song
Wang, Ahmed Tewfik, George Shih, Ying Ding, Yifan Peng
- Abstract要約: 放射能特性を利用して異常分類性能を向上させるためのエンドツーエンドフレームワークであるChexRadiNetを開発した。
我々は、NIH ChestX-ray、CheXpert、MIMIC-CXRの3つの公開データセットを用いてChexRadiNetフレームワークを評価する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 14.679677447702653
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Chest X-ray becomes one of the most common medical diagnoses due to its
noninvasiveness. The number of chest X-ray images has skyrocketed, but reading
chest X-rays still have been manually performed by radiologists, which creates
huge burnouts and delays. Traditionally, radiomics, as a subfield of radiology
that can extract a large number of quantitative features from medical images,
demonstrates its potential to facilitate medical imaging diagnosis before the
deep learning era. In this paper, we develop an end-to-end framework,
ChexRadiNet, that can utilize the radiomics features to improve the abnormality
classification performance. Specifically, ChexRadiNet first applies a
light-weight but efficient triplet-attention mechanism to classify the chest
X-rays and highlight the abnormal regions. Then it uses the generated class
activation map to extract radiomic features, which further guides our model to
learn more robust image features. After a number of iterations and with the
help of radiomic features, our framework can converge to more accurate image
regions. We evaluate the ChexRadiNet framework using three public datasets: NIH
ChestX-ray, CheXpert, and MIMIC-CXR. We find that ChexRadiNet outperforms the
state-of-the-art on both disease detection (0.843 in AUC) and localization
(0.679 in T(IoU) = 0.1). We will make the code publicly available at
https://github.com/bionlplab/lung_disease_detection_amia2021, with the hope
that this method can facilitate the development of automatic systems with a
higher-level understanding of the radiological world.
- Abstract(参考訳): 胸部X線は非侵襲性から最も一般的な診断の1つである。
胸部X線画像の数は急上昇したが、胸部X線を読むのは放射線技師が手動で行い、火傷や遅延が発生する。
医学画像から多くの定量的特徴を抽出できる放射線学のサブフィールドとして伝統的にラジオミクスは、深層学習時代以前の医療画像診断を容易にする可能性を示している。
本稿では,放射能特性を利用して異常分類性能を向上させるためのエンドツーエンドフレームワークであるChexRadiNetを開発する。
具体的には、chexradinetはまず、胸部x線を分類し異常領域を強調するために、軽量だが効率的なトリプレット・アテンション機構を適用した。
次に、生成されたクラスアクティベーションマップを使用して放射能特徴を抽出し、より堅牢な画像特徴を学習するためのモデルをさらにガイドする。
何度も繰り返し、放射能的特徴の助けを借りて、我々のフレームワークはより正確な画像領域に収束できる。
我々は、NIH ChestX-ray、CheXpert、MIMIC-CXRの3つの公開データセットを用いてChexRadiNetフレームワークを評価する。
その結果,chexradinetは疾患検出(aucでは0.843)と局在(t(iou) = 0.1)の両方において最先端を上回っていることがわかった。
我々は,この手法が,放射線学の世界をより高度に理解した自動システムの開発を促進することを期待して,このコードをhttps://github.com/bionlplab/lung_disease_detection_amia2021で公開する。
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