論文の概要: Contrastive Representation Learning for Whole Brain Cytoarchitectonic
Mapping in Histological Human Brain Sections
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2011.12865v2
- Date: Thu, 28 Jan 2021 10:17:01 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-09-21 03:57:11.993900
- Title: Contrastive Representation Learning for Whole Brain Cytoarchitectonic
Mapping in Histological Human Brain Sections
- Title(参考訳): 組織学的ヒト脳切片における全脳細胞構造マッピングのためのコントラスト表現学習
- Authors: Christian Schiffer, Katrin Amunts, Stefan Harmeling, Timo Dickscheid
- Abstract要約: 本稿では,顕微鏡画像パッチを頑健な微細構造特徴に符号化するための対照的な学習手法を提案する。
この学習課題を用いて事前学習したモデルは、最近提案された補助課題に基づいて事前学習したモデルと同様に、スクラッチから訓練したモデルよりも優れていることを示す。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.4588028371034407
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Cytoarchitectonic maps provide microstructural reference parcellations of the
brain, describing its organization in terms of the spatial arrangement of
neuronal cell bodies as measured from histological tissue sections. Recent work
provided the first automatic segmentations of cytoarchitectonic areas in the
visual system using Convolutional Neural Networks. We aim to extend this
approach to become applicable to a wider range of brain areas, envisioning a
solution for mapping the complete human brain. Inspired by recent success in
image classification, we propose a contrastive learning objective for encoding
microscopic image patches into robust microstructural features, which are
efficient for cytoarchitectonic area classification. We show that a model
pre-trained using this learning task outperforms a model trained from scratch,
as well as a model pre-trained on a recently proposed auxiliary task. We
perform cluster analysis in the feature space to show that the learned
representations form anatomically meaningful groups.
- Abstract(参考訳): 細胞architectonic mapsは、組織学的組織断面から測定した神経細胞体の空間配置の観点から、脳のミクロ構造的参照配列を提供する。
最近の研究は、畳み込みニューラルネットワークを用いた視覚系における細胞構造的領域の自動セグメンテーションを初めて提供した。
我々は、このアプローチを拡張して、より広い範囲の脳領域に適用し、完全な人間の脳をマッピングするためのソリューションを構想する。
近年の画像分類の成功に触発されて, 細胞構造学的領域の分類に有効である, 顕微鏡画像パッチを頑健な微細構造特徴に符号化するための対照的な学習目標を提案する。
この学習タスクを用いて事前学習したモデルが,最近提案された補助タスクで事前学習されたモデルと同様に,スクラッチからトレーニングされたモデルよりも優れていることを示す。
特徴空間においてクラスター分析を行い,学習表現が解剖学的に有意なグループを形成することを示す。
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