論文の概要: Structure Embedded Nucleus Classification for Histopathology Images
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2302.11416v1
- Date: Wed, 22 Feb 2023 14:52:06 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-02-23 14:54:42.909139
- Title: Structure Embedded Nucleus Classification for Histopathology Images
- Title(参考訳): 病理組織像のための構造埋め込み核分類
- Authors: Wei Lou, Xiang Wan, Guanbin Li, Xiaoying Lou, Chenghang Li, Feng Gao,
Haofeng Li
- Abstract要約: ほとんどのニューラルネットワークに基づく手法は、局所的な畳み込みの受容領域に影響を受けている。
本稿では,核輪郭を順にサンプリングした点列に変換する新しい多角構造特徴学習機構を提案する。
次に、核をノードとするグラフ構造に組織像を変換し、その表現に核の空間分布を埋め込むグラフニューラルネットワークを構築する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 51.02953253067348
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Nuclei classification provides valuable information for histopathology image
analysis. However, the large variations in the appearance of different nuclei
types cause difficulties in identifying nuclei. Most neural network based
methods are affected by the local receptive field of convolutions, and pay less
attention to the spatial distribution of nuclei or the irregular contour shape
of a nucleus. In this paper, we first propose a novel polygon-structure feature
learning mechanism that transforms a nucleus contour into a sequence of points
sampled in order, and employ a recurrent neural network that aggregates the
sequential change in distance between key points to obtain learnable shape
features. Next, we convert a histopathology image into a graph structure with
nuclei as nodes, and build a graph neural network to embed the spatial
distribution of nuclei into their representations. To capture the correlations
between the categories of nuclei and their surrounding tissue patterns, we
further introduce edge features that are defined as the background textures
between adjacent nuclei. Lastly, we integrate both polygon and graph structure
learning mechanisms into a whole framework that can extract intra and
inter-nucleus structural characteristics for nuclei classification.
Experimental results show that the proposed framework achieves significant
improvements compared to the state-of-the-art methods.
- Abstract(参考訳): 核分類は病理組織学画像解析に有用な情報を提供する。
しかし、異なる核種の出現における大きな変化は、核の同定に困難を引き起こす。
ほとんどのニューラルネットワークベースの方法は畳み込みの局所受容場に影響され、核の空間分布や核の不規則な輪郭形状にはあまり注意を払わない。
本稿では、まず、核の輪郭を順番にサンプリングされた点列に変換する新しいポリゴン構造特徴学習機構を提案し、キーポイント間の連続的な変化を集約して学習可能な形状特徴を得るリカレントニューラルネットワークを用いる。
次に,病理像を核をノードとするグラフ構造に変換し,その表現に核の空間分布を埋め込むグラフニューラルネットワークを構築する。
核のカテゴリと周囲の組織パターンの相関を捉えるため、隣接した核間の背景テクスチャとして定義されるエッジの特徴をさらに導入する。
最後に,我々は多角形とグラフ構造学習機構を,核内および核間構造特性を抽出する枠組み全体に組み入れた。
実験の結果,提案手法は最先端手法に比べて大幅な改善が得られた。
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